结论：在工伤停工留薪期结束无法上班，请病假公司不批的情况下，无论是主动辞职还是等待公司开除，都不是最优选择。我建议先与公司协商，并了解自身权益，若协商无果，再考虑通过法律途径解决。以下是对此问题的详细分析：
一、主动辞职的利弊
利：主动辞职可以避免被公司开除可能带来的名誉上的负面影响，同时，如果公司存在违法行为或未履行应尽义务，主动辞职后仍有可能通过法律途径维护自身权益。
弊：
- 经济补偿：根据《劳动合同法》的相关规定，员工主动辞职通常无法获得经济补偿，除非公司存在违法行为（如未支付劳动报酬、未提供劳动条件等）。
- 失业保险：主动辞职可能影响失业保险的领取，具体需根据当地政策规定。
- 再就业：虽然主动辞职不会直接对再就业产生负面影响，但如果辞职原因未妥善处理，可能在背景调查时引发潜在雇主的疑虑。
二、公司开除的利弊
利：如果公司违法开除员工，员工有权要求公司支付赔偿金，这通常包括经济补偿的两倍。此外，被开除员工在符合一定条件下，还可以领取失业保险。
弊：
- 名誉影响：被公司开除可能对个人名誉产生一定负面影响，尤其是在行业内。
- 法律风险：如果公司开除行为合法，员工将无法获得赔偿金，且可能面临再就业时的背景调查问题。
- 心理压力：被开除可能带来较大的心理压力，影响个人情绪和生活。
三、建议措施
与公司协商：
- 首先，尝试与公司沟通，说明自身情况，请求延长病假或调整工作岗位。
- 如果公司拒绝，可以要求公司出具书面拒绝理由，并保留相关证据。
了解自身权益：
- 查阅《劳动合同法》、《工伤保险条例》等相关法律法规，了解自身在工伤期间的权益。
- 如果公司存在违法行为，如未支付工伤待遇、未提供劳动条件等，可以依法向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
寻求法律援助：
- 如果与公司协商无果，且自身权益受到侵害，可以寻求法律援助或咨询专业律师。
- 律师可以帮助你分析案情，提供法律建议，并代表你与公司进行谈判或提起诉讼。
考虑再就业：
- 在处理工伤纠纷的同时，也可以开始考虑再就业问题。
- 更新简历，关注招聘信息，积极参加面试，为未来的职业发展做好准备。
四、特殊情况下的处理
- 如果工伤导致你完全丧失劳动能力，且符合相关条件，可以申请提前退休或享受工伤保险待遇中的伤残津贴等。
- 如果工伤导致你部分丧失劳动能力，且无法从事原工作，公司应为你调整工作岗位或提供适当的劳动条件。如果公司拒绝，你可以依法维权。
总之，在工伤停工留薪期结束无法上班的情况下，不要轻易选择主动辞职或等待公司开除。先与公司协商，了解自身权益，并寻求法律援助或咨询专业律师是更为明智的选择。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。