结论：在僵尸企业员工安置中，对于没有正式招工手续但存在事实劳动关系的员工，其安置应基于事实劳动关系的认定，并依法保障其合法权益。具体安置方式需结合企业实际情况、员工意愿及法律法规要求综合确定。
一、事实劳动关系的认定
法律依据：根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号）的规定，用人单位招用劳动者未订立书面劳动合同，但同时具备下列情形的，劳动关系成立：
- 用人单位和劳动者符合法律、法规规定的主体资格；
- 用人单位依法制定的各项劳动规章制度适用于劳动者，劳动者受用人单位的劳动管理，从事用人单位安排的有报酬的劳动；
- 劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。
证据收集：在认定事实劳动关系时，员工应尽可能收集并保留能够证明其与企业存在劳动关系的证据，如工资支付记录、工作证、考勤记录、同事证言等。
二、员工安置方式
协商安置：
- 企业应与员工进行充分沟通，了解员工的意愿和需求，协商制定安置方案。
- 安置方案可以包括继续留用、经济补偿、转岗培训、内部退养等多种方式。
经济补偿：
- 若企业因经营困难无法继续留用员工，应依法支付经济补偿。
- 经济补偿的计算标准通常依据员工在企业的工作年限和月工资水平确定，具体可参照《劳动合同法》的相关规定。
- 计算公式：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
转岗培训：
- 对于有转岗意愿和能力的员工，企业可以提供转岗培训，帮助员工适应新的工作岗位。
- 转岗培训期间，企业应支付员工相应的工资和福利待遇。
内部退养：
- 对于符合内部退养条件的员工，企业可以与其协商办理内部退养手续。
- 内部退养期间，企业应按月支付员工一定的生活费，并为其缴纳社会保险费。
三、法律保障与救济途径
法律保障：
- 员工在安置过程中应依法维护自己的合法权益，如要求企业支付经济补偿、提供转岗培训等。
- 企业应遵守相关法律法规，不得违法解除或终止与员工的劳动关系。
救济途径：
- 若员工对企业的安置方案有异议，可以与企业进行协商；协商不成的，可以向劳动争议调解组织申请调解；调解不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 对仲裁裁决不服的，员工可以向人民法院提起诉讼。
四、特殊情况处理
- 对于历史遗留问题：如员工入职时间较早，当时未签订书面劳动合同且未缴纳社会保险费，企业应积极与员工协商解决，尽可能补缴社会保险费或提供其他补偿。
- 对于拒不配合的员工：企业应耐心沟通，了解其拒不配合的原因，并尝试通过协商、调解等方式解决争议。若员工坚持无理要求，企业可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
在处理僵尸企业员工安置问题时，企业应充分考虑员工的合法权益和企业的实际情况，制定合理的安置方案，并依法履行相关手续。员工也应积极维护自己的合法权益，通过合法途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。