结论前置：不是工伤的情况下，上班去做手术是否会被辞退以及如何赔偿，需分情况讨论，具体如下：

1. 若员工不存在法定过错，用人单位不得随意辞退

   • 根据《劳动合同法》规定，用人单位解除劳动合同需有法定理由，如员工严重违反用人单位规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害、被依法追究刑事责任等。若员工仅是因自身疾病（非工伤）需上班期间去做手术，且不存在上述法定过错情形，用人单位以此为由辞退员工，属于违法解除劳动合同。
   • 赔偿方面：根据《劳动合同法》第八十七条规定，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。例如，员工在单位工作3年，月工资为5000元，若用人单位违法辞退，则需支付赔偿金为3×5000×2 = 30000元。

2. 若员工存在法定过错，用人单位可依法辞退且无需赔偿

   • 如果员工在上班去做手术这件事上存在严重违反用人单位规章制度等法定过错情形，比如未经请假擅自离岗去做手术，且该行为严重影响了用人单位的正常生产经营秩序，给用人单位造成了重大损失等，用人单位可以依据《劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同，且无需支付经济补偿或赔偿金。不过，用人单位需要承担举证责任，证明员工存在上述法定过错情形。

3. 若员工因患病或非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位一般不得辞退

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，用人单位不得依据《劳动合同法》第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同。若用人单位在医疗期内辞退员工，同样属于违法解除，需按照上述违法解除的标准支付赔偿金。
   • 特殊情况：如果员工医疗期满后，不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同，但需按照《劳动合同法》第四十七条的规定支付经济补偿。例如，员工医疗期满后，无法胜任原岗位工作，单位为其调岗后仍不能胜任，此时单位提前30天书面通知员工解除合同，若员工在单位工作2年，月工资6000元，则单位需支付经济补偿2×6000 = 12000元。

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