针对员工没有按商场要求开门营业，商场对员工进行处罚的情况，作为公司，我们可以采取以下步骤来回复和处理：

一、了解具体情况

首先，我们需要全面了解事件的经过，包括员工未按时开门营业的具体原因、商场的处罚措施以及处罚是否符合双方之前的约定或相关法律法规。

二、内部沟通与核查

1. 与员工沟通：了解员工未按时开门的具体原因，是否存在特殊情况或误解。同时，向员工明确公司的立场和态度，即尊重商场的规定，但也关心员工的权益。

2. 核查事实：通过查看监控录像、工作记录等方式，核实员工是否确实存在未按时开门的行为，以及该行为是否对商场运营造成了实际影响。

三、回复商场

在了解清楚情况后，我们可以向商场提交一份正式的回复函，内容可以包括：

1. 对事件的确认：首先确认员工未按时开门的事实，但也可以提出如果存在特殊情况或误解，希望商场能够考虑给予一定的宽容和理解。

2. 表达立场：明确表示公司尊重商场的管理规定，并会加强对员工的管理和培训，确保类似情况不再发生。同时，也希望商场在处理员工问题时能够遵循相关法律法规，确保处罚的公正性和合理性。

3. 提出解决方案：针对此次事件，提出具体的解决方案，如加强对员工的培训、调整工作时间安排等，以确保商场的正常运营和员工的合法权益。

4. 请求反馈：最后，可以请求商场对公司的回复和处理措施给予反馈，以便双方进一步沟通和协商。

四、后续跟进与改进

1. 加强员工培训：针对此次事件，加强对员工关于商场规定、工作时间安排等方面的培训，确保员工能够严格遵守相关规定。

2. 完善管理制度：对公司的管理制度进行全面检查和评估，如果存在漏洞或不足，及时进行完善和改进。

3. 保持与商场的沟通：加强与商场的沟通和协作，共同维护良好的合作关系和商场秩序。

综上所述，作为公司，在面对员工未按时开门营业被商场处罚的情况时，应全面了解情况、内部沟通与核查、正式回复商场，并加强后续跟进与改进，以确保类似问题不再发生，并维护公司与商场的良好合作关系。