结论前置：针对员工入职时约定双休，之后公司调整工作时间要求单休而员工不接受的情况，公司不能单方面强制变更，需与员工协商一致；若协商不成，公司应尊重员工选择，不得因此解除劳动合同或采取不利措施，否则可能面临法律风险。以下从多个角度详细分析：
劳动合同变更的角度：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。这意味着，公司不能单方面改变与员工已经约定的双休工作制，而要求员工接受单休，除非双方能够就此达成一致意见。
- 如果公司未经员工同意，擅自将双休改为单休，这构成了对劳动合同的违约行为。员工有权拒绝这种变更，并可以要求公司继续履行原劳动合同中的双休约定。
员工权益保护的角度：
- 员工有权享受法定的休息休假权益，包括双休日。如果公司强制要求员工接受单休，而员工不接受，公司不得因此解除劳动合同或采取其他不利措施，如降薪、调岗等。
- 如果公司因此解除劳动合同，员工可以依法向劳动争议仲裁委员会或人民法院提起诉讼，要求公司支付违法解除劳动合同的赔偿金。
公司合规操作的角度：
- 如果公司确实因为业务需要，希望调整工作时间制度，应当提前与员工进行充分沟通，说明调整的原因和必要性，并征求员工的意见。
- 在协商过程中，公司可以提出合理的补偿方案，如增加加班费、提供调休机会等，以争取员工的理解和支持。
- 如果双方能够达成一致意见，应当签订书面的劳动合同变更协议，明确变更的内容、生效时间等关键条款。
实际操作建议：
- 对于公司而言，应当谨慎对待工作时间的变更问题，避免因为操作不当而引发劳动争议。在变更前，应当充分评估变更的必要性和可行性，以及可能带来的法律风险和成本。
- 对于员工而言，如果公司提出变更工作时间的请求，应当根据自己的实际情况和需求进行考虑。如果认为变更不合理或无法接受，可以明确表达自己的意见，并要求公司继续履行原劳动合同。
- 如果双方无法达成一致意见，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
举例说明：假设某公司因为业务旺季需要，希望将部分员工的双休改为单休。在提出这一请求前，公司应当与员工进行充分沟通，说明业务旺季的情况和变更工作时间的必要性。同时，公司可以提出增加加班费或提供调休机会等补偿方案，以争取员工的理解和支持。如果员工同意变更，双方应当签订书面的劳动合同变更协议；如果员工不同意变更，公司应当尊重员工的选择，不得因此解除劳动合同或采取其他不利措施。
后续行动建议：如果公司已经单方面变更了工作时间制度，而员工不接受并因此产生了劳动争议，建议双方首先通过协商解决争议；如果协商不成，可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在任何情况下，都应当保持冷静和理性，通过合法途径维护自己的权益。
最后，如果你或你所在的公司遇到类似问题，或者有其他劳动纠纷方面的疑问，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。