针对您提出的“病假需要休息三个月，怎么向公司请假不扣工资”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确结论：
公司仅为您缴纳社保而不发放病假工资的做法是不合法的。您有权要求公司按照法律规定支付病假工资，并可通过合法途径来维护自己的权益。
二、法律依据与详细分析：
社保缴纳：
- 根据《中华人民共和国社会保险法》及相关规定，用人单位在员工请病假期间，仍需按时足额缴纳社会保险费，这包括您个人应缴纳的部分和单位应缴纳的部分。因此，公司继续为您缴纳社保是合法的，也是其应尽的义务。
工资支付：
- 依据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，职工在病假期间，用人单位应当支付病假工资。具体支付标准通常由用人单位按照不低于当地最低工资标准的80%自主确定，但也有一些地方或行业有更具体的规定。
- 对于长期病假（如三个月），支付标准可能更为细致。一般来说，前两个月可能按原工资标准支付，从第三个月开始，根据工龄确定支付比例。例如，工作年限不满十年的，可能支付工资的90%；工作年限满十年的，工资可能照发。但具体比例还需根据您所在地的具体规定和公司的政策来确定。
三、实际操作建议：
与公司协商：
- 首先，您可以尝试与公司的人力资源部门或上级领导进行友好沟通，明确指出公司的做法不符合法律规定，并要求其按照规定支付病假工资。在沟通时，您可以提供相关的法律依据和支付标准，以增强说服力。
收集证据：
- 在协商过程中及之后，务必妥善保存所有相关证据，包括医院的诊断证明、病假条、挂号记录、劳动合同、工资条等。这些证据将在后续维权过程中发挥重要作用，有助于证明您的病假情况和工资支付情况。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，您可以向当地的劳动监察大队投诉。劳动监察部门有权对公司的违法行为进行调查和处理，并可以责令公司改正并支付相应工资。在投诉时，您需要提供详细的证据和情况说明。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若劳动监察部门的处理未能解决问题，您还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁裁决具有法律效力，公司必须履行。如仲裁结果仍不满意，您还可以向法院提起诉讼，通过司法程序来维护自己的合法权益。
四、额外建议：
- 在请假前，建议您先了解公司关于病假的具体政策和规定，以便更好地与公司进行沟通。
- 如果可能的话，您可以咨询专业的劳动法律师或法律援助机构，以获取更具体的法律建议和帮助。
综上所述，公司仅为您缴纳社保而不发放病假工资的做法是不合法的。您应依法采取相应措施来维护自己的合法权益，确保病假期间能够得到应有的工资支付。希望以上解答能够对您有所帮助。