结论：单位交灵活就业社保的情况下，是否可以申请劳动仲裁，取决于具体争议内容是否属于劳动仲裁的受理范围。如果争议内容属于劳动仲裁的受理范围，那么即使单位交的是灵活就业社保，劳动者仍然可以申请劳动仲裁。
分析：
劳动仲裁的受理范围：
- 劳动仲裁主要受理因确认劳动关系发生的争议，以及因订立、履行、变更、解除和终止劳动合同等发生的争议。这包括但不限于工资支付、工作时间、休息休假、社会保险、福利、培训以及劳动保护等方面的争议。
- 如果单位交灵活就业社保的行为，引发了与劳动者之间的社会保险方面的争议，且该争议属于劳动仲裁的受理范围（例如，单位未按照法律规定为劳动者缴纳社会保险费，或者缴纳的险种、基数等不符合法律规定），那么劳动者可以申请劳动仲裁。
灵活就业社保与劳动仲裁的关系：
- 灵活就业社保通常指的是针对非全日制、临时性、弹性工作等灵活就业形式的人员所缴纳的社会保险。然而，这并不意味着单位可以以此为由规避对全日制劳动者的社会保险缴纳义务。
- 如果劳动者与单位之间存在全日制劳动关系，而单位却按照灵活就业的形式为劳动者缴纳社会保险，这可能违反了相关法律规定。在此情况下，劳动者有权就社会保险缴纳问题申请劳动仲裁。
申请劳动仲裁的条件和流程：
- 劳动者申请劳动仲裁，需要满足一定的条件，如存在劳动关系、争议属于劳动仲裁受理范围等。
- 申请劳动仲裁的流程通常包括提交仲裁申请书、仲裁委员会受理、开庭审理、裁决等步骤。劳动者需要按照规定的流程和要求进行申请和参与仲裁活动。
建议：
- 如果劳动者认为单位交灵活就业社保的行为侵犯了自己的合法权益，且该争议属于劳动仲裁的受理范围，那么建议劳动者及时收集相关证据（如劳动合同、工资单、社保缴纳记录等），并向当地的劳动仲裁委员会提交仲裁申请书。
- 在申请劳动仲裁前，劳动者也可以尝试与单位进行协商，看是否能够通过协商解决争议。如果协商无果，再考虑申请劳动仲裁。
可能后果：
- 如果劳动仲裁委员会认定单位的交灵活就业社保行为违反了相关法律规定，且侵害了劳动者的合法权益，那么可能会裁决单位承担相应的法律责任，如补缴社会保险费、支付经济补偿等。
- 如果劳动者的仲裁请求被驳回，或者对仲裁裁决不服，劳动者还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。
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