结论：综合工时制下，企业将原本白班8小时调整为夜班12小时是否合理，需结合以下因素综合判断，不能一概而论：

1. 是否符合综合工时制的审批要求
   根据《劳动法》第三十九条及《关于企业实行不定时工作制和综合计算工时工作制的审批办法》，企业实行综合工时制需经劳动行政部门审批，且需明确适用岗位、周期（如周、月、季、年）及平均工时标准。若企业未履行审批程序，或审批范围未涵盖夜班岗位，则调整工时可能违法。

2. 是否超出法定工时上限
   综合工时制下，劳动者在周期内的平均工时不得超过法定标准（每日8小时、每周40小时）。例如：

   • 若以周为周期，劳动者一周内总工时不得超过40小时（即使某天工作12小时，其他天需相应减少）；
     
   • 若以月为周期，总工时不得超过166.64小时（20.83天×8小时）。
     若调整后导致周期内总工时超标，即使单日12小时未超每日上限（每日一般不超过11小时，特殊情况需经审批），仍属违法。

3. 是否保障劳动者健康及补偿权益

   • 健康权：夜班12小时可能涉及连续作业，企业需遵守《劳动法》关于“劳动者连续工作不得超过11小时”的限制（特殊情况需经审批），并确保劳动者有足够休息时间（如班间休息、调休）。
     
   • 加班补偿：若周期内总工时超标，超出部分应按150%支付加班费（工作日）或200%（休息日且未调休）。若企业未支付，则违法。

4. 程序合法性
   企业调整工时需与工会或劳动者协商一致（《劳动合同法》第四条），并书面变更劳动合同。若未履行协商程序，劳动者可主张调整无效。

建议行动：

• 劳动者可要求企业出示综合工时制审批文件，核对岗位、周期是否匹配；
  
• 计算周期内总工时，确认是否超标；
  
• 若企业违法，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，主张加班费、补休或解除合同经济补偿。
  

如有具体工时记录或合同条款，可进一步分析，欢迎随时向我咨询。