结论：工厂安排12小时夜班还要加班，在多数情况下是不合理的，可能违反了我国劳动法关于工作时间和加班限制的规定。不过，具体是否合理还需结合实际情况判断，比如是否存在特殊工时制度、是否支付了加班费等。以下从多个角度进行分析：
一、法律规定的工作时间与加班限制
根据我国《劳动法》的相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。如果因生产经营需要，用人单位可以与工会和劳动者协商后延长工作时间，但一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过3小时，但是每月不得超过36小时。
分析：工厂安排12小时夜班，已经超出了法定每日8小时的工作时间。如果在此基础上还要加班，那么加班时间很可能也超出了法律规定的限制。因此，从工作时间和加班限制的角度来看，工厂的这种安排是不合理的。
二、特殊工时制度下的工作时间
虽然一般情况下工厂的工作时间应遵守上述规定，但如果工厂实行的是特殊工时制度，如综合计算工时工作制或不定时工作制，那么工作时间可能会有所不同。不过，即使实行特殊工时制度，也需要经过劳动行政部门的批准，并且要确保劳动者的平均工作时间和休息休假权利不受侵害。
分析：如果工厂确实实行了特殊工时制度，并且已经获得了劳动行政部门的批准，那么12小时夜班和加班的安排可能在某种程度上是合法的。但即便如此，工厂也需要确保劳动者的总工作时间不超过法定限制，并且要支付相应的加班费。
三、加班费的支付问题
无论工厂是否实行特殊工时制度，如果安排劳动者加班，都需要支付加班费。加班费的标准根据加班时间和加班方式的不同而有所差异。例如，工作日加班的加班费不低于工资的150%，休息日加班又不能安排补休的加班费不低于工资的200%，法定节假日加班的加班费不低于工资的300%。
分析：如果工厂安排12小时夜班还要加班，但没有支付相应的加班费，那么这种安排不仅不合理，还违反了劳动法的规定。劳动者有权要求工厂支付加班费，并可以向劳动监察部门投诉。
四、劳动者的健康与安全
长时间的工作和加班可能会对劳动者的身体健康和安全造成影响。工厂有责任确保劳动者的工作环境安全、健康，并合理安排工作时间和休息时间。
分析：从保护劳动者健康和安全的角度来看，工厂安排12小时夜班还要加班也是不合理的。这种安排可能会增加劳动者的工作压力和疲劳程度，进而影响其工作效率和身体健康。
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