结论前置：夜班上12个小时，在未经特殊工时制度批准的情况下，通常属于加班，且可能违反了《中华人民共和国劳动法》中关于工作时间和加班时长的规定。
一、关于工作时间与加班的基本规定
标准工时制：
- 根据《中华人民共和国劳动法》，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时（通常实践中以40小时为准）的标准工时制。
- 夜班工作，虽然法律没有明确规定具体的时间段，但通常认为是在当日22点至次日6点间从事的劳动或工作。若安排劳动者上12小时夜班，显然超出了标准工时，属于延长工作时间，即加班。
加班限制：
- 用人单位因生产经营需要延长工作时间的，必须与工会和劳动者协商，并且一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下，每日不得超过3小时，每月不得超过36小时。
- 因此，安排12小时夜班，在未经特殊工时制度批准的情况下，显然违反了这一加班时长限制。
二、加班报酬的支付
加班工资标准：
- 安排劳动者延长工作时间的，应支付不低于工资的150%的工资报酬；
- 休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，应支付不低于工资的200%的工资报酬；
- 法定休假日安排劳动者工作的，应支付不低于工资的300%的工资报酬。
实例计算：
- 假设劳动者正常日工资为200元，工作日进行了12小时夜班工作，其中8小时为正常工作时间，超出8小时的部分（4小时）应按150%支付加班工资。
- 加班工资计算：\((200 \div 8) \times 4 \times 150\% = 150\)（元）。
- 因此，该劳动者当日应得工资为正常工资200元加上加班工资150元，共计350元。
三、特殊工时制度下的夜班工作
- 不定时工作制与综合计算工时工作制：
- 对于一些特殊行业、岗位，经劳动行政部门批准，可以实行不定时工作制或综合计算工时工作制。
- 在综合计算工时工作制下，虽然计算周期内的总工作时间可以灵活安排，但也不能超过法定标准工作时间。若计算周期内安排12小时夜班，且累计超出部分未按规定支付加班费，则同样构成违法。
四、劳动保护与健康保障
- 用人单位必须为夜班劳动者提供必要的劳动保护用品，确保其安全与健康。
- 对于可能对身体健康造成危害的夜班岗位，用人单位还应定期组织健康检查，这是用人单位的法定义务。
五、法律救济途径
- 如果用人单位违反上述规定，劳动者有权要求支付加班工资，并可以通过以下途径维护自己的合法权益：
- 与用人单位协商解决；
- 向当地劳动监察部门投诉；
- 申请劳动仲裁；
- 必要时可向法院提起诉讼。
总结与建议：夜班上12个小时，在未经特殊工时制度批准的情况下，通常属于加班，且可能违反了劳动法的相关规定。劳动者应当了解自己的权益，并在必要时采取法律手段来维护自己的合法权益。如果用人单位安排了长时间的夜班工作，劳动者可以要求用人单位支付加班费，并关注自己的身体健康状况。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。