合同上规定不走正常流程扣除工资，这样的条款一般是无效的，用人单位不能据此扣除工资。以下从几个方面为你详细分析：

法律背景

根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。这意味着，用人单位不能单方面制定扣除工资的条款，更不能制定违反法律规定的扣除工资条款。

条款无效的情形

1. 违反法律强制性规定：如果合同中的扣除工资条款违反了法律的强制性规定，如未经劳动者同意擅自扣除工资、扣除工资的比例超过法定限度等，那么这些条款是无效的。
2. 未经民主程序制定：如前所述，涉及劳动者切身利益的规章制度应当经职工代表大会或者全体职工讨论，与工会或者职工代表平等协商确定。如果扣除工资的条款未经这一民主程序制定，那么它可能因程序违法而无效。
3. 显失公平：如果扣除工资的条款明显对劳动者不利，如扣除的工资数额过大、扣除的条件过于苛刻等，那么这些条款可能因显失公平而被认定为无效。

法律建议

1. 与用人单位协商：如果你发现合同中的扣除工资条款存在问题，首先可以尝试与用人单位进行协商，要求修改或删除这些条款。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，你可以向当地的劳动监察部门投诉，请求他们介入调查并处理。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果不能满足你的需求，你还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。

可能的法律后果

如果用人单位依据无效的扣除工资条款扣除了你的工资，那么它可能面临以下法律后果：

1. 补发工资：用人单位需要补发被扣除的工资，并可能支付相应的利息或赔偿金。
2. 行政处罚：劳动监察部门可以对用人单位进行行政处罚，如罚款、责令改正等。
3. 民事赔偿：如果用人单位的行为给你造成了损失，你还可以要求它承担民事赔偿责任。

综上所述，合同上规定不走正常流程扣除工资的条款一般是无效的。如果你遇到了这样的问题，不要慌张，可以按照上述建议采取相应的措施来维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。