元旦当天加班的，补休不能一天抵三天，但用人单位需支付不低于工资300%的加班费；若安排补休，仍需按300%标准支付工资，不能以“一天抵一天”的方式抵消加班费义务。 以下是具体分析：

1. 元旦的法律性质
   根据《全国年节及纪念日放假办法》，元旦（1月1日）属于法定节假日，全年共11天。法定节假日是劳动者依法享有的休息权，用人单位若安排加班，需承担更高的支付义务。

2. 加班费支付标准
   根据《劳动法》第44条，法定节假日加班的，用人单位需支付不低于工资300%的加班费，且不得以补休替代。这一规定是强制性的，目的是保障劳动者在特殊日期的休息权和经济利益。

3. 补休的适用范围
   补休仅适用于休息日（如周末）加班的情况。若用人单位在休息日安排加班且无法安排补休的，需支付200%的工资；若能安排补休，则无需支付加班费。但法定节假日加班不适用此规则，补休不能替代300%的工资支付义务。

4. 常见误区澄清
   部分用人单位可能误以为“元旦加班可以安排补休，且按1:1抵消加班费”，这是错误的。即使安排补休，仍需按300%标准支付工资，补休仅是额外福利，不能免除法定支付义务。

建议：若您遇到用人单位以“补休一天抵三天”为由拒绝支付300%加班费，可保留加班证据（如考勤记录、加班通知等），向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。