结论前置：针对你们保安部全体员工因每天上班12小时、做六休一而申请劳动仲裁加班工资的情况，需要准备的材料主要包括劳动关系证明、加班事实证据、工资支付记录以及仲裁申请书等。以下是对这些材料的详细说明：
劳动关系证明：
- 劳动合同：这是证明你们与用人单位之间存在劳动关系的基础文件。如果劳动合同遗失或未签订，可以尝试提供其他证明劳动关系的材料，如工作证、服务证、考勤记录、工资条、同事证言等。
加班事实证据：
- 考勤记录：这是证明你们实际工作时间的关键证据。考勤记录应详细记录你们的上下班时间，以及加班的具体时长。如果用人单位使用电子考勤系统，可以尝试通过截图或打印考勤记录的方式保存证据。
- 加班通知或安排：如果用人单位以书面形式通知你们加班，或者通过工作群、邮件等方式安排加班，这些通知或安排也是证明加班事实的重要证据。
- 同事证言：如果有多名同事同时加班，他们的证言也可以作为证明加班事实的辅助证据。
工资支付记录：
- 工资条或银行转账记录：这些记录可以证明你们的工资支付情况，包括基本工资、加班工资等。如果用人单位未提供工资条，可以通过银行转账记录来证明工资支付情况。
- 工资计算方式说明：如果可能的话，提供一份关于工资计算方式的说明，特别是加班工资的计算方式，这有助于仲裁机构更准确地计算你们应得的加班工资。
仲裁申请书：
- 申请书内容：仲裁申请书应详细说明你们的仲裁请求、事实和理由。在事实和理由部分，应详细阐述你们每天上班12小时、做六休一的情况，以及用人单位未支付加班工资的事实。
- 申请人信息：在申请书中，应准确填写所有申请人的姓名、性别、年龄、职业、工作单位和住所等信息。
- 被申请人信息：同样，应准确填写被申请人的名称、住所和法定代表人或主要负责人的姓名、职务等信息。
额外建议：
- 集体仲裁的特别准备：由于你们是保安部全体员工一起申请仲裁，因此需要确保所有申请人的信息准确无误，并共同签署仲裁申请书。同时，可以推选一名或几名代表来代表全体申请人参与仲裁过程。
- 证据的整理和保存：在准备材料的过程中，务必注意证据的整理和保存。将所有证据按照时间顺序或类别进行整理，并妥善保存原件或复印件。在仲裁过程中，这些证据将起到至关重要的作用。
- 法律咨询和援助：如果你们对仲裁过程或法律条款有任何疑问或不确定的地方，建议及时向我咨询。作为专业律师，我可以为你们提供详细的法律解释和指导，帮助你们更好地维护自己的合法权益。
可能涉及的法律后果：
- 如果仲裁机构认定用人单位确实存在未支付加班工资的行为，那么用人单位将被责令支付拖欠的加班工资，并可能面临罚款等法律责任。
- 如果用人单位对仲裁结果不服，还可以在法定期限内向人民法院提起诉讼。但在此之前，你们应确保已经充分准备了所有必要的证据和材料，以应对可能的法律诉讼。
希望以上信息能对你们有所帮助。如果有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。