医疗期满后不能继续工作，用人单位在合法解除劳动合同时需支付经济补偿金；若违法解除，则需支付双倍赔偿金。同时，特定情况下还需支付医疗补助费。以下是详细分析：
一、合法解除合同的赔偿
经济补偿金的计算：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，当劳动者患病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作时，用人单位有权提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资后解除劳动合同，并需依法支付经济补偿金。
- 经济补偿金按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。若劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
医疗补助费（视地方规定而定）：
- 在某些地区，除了经济补偿金外，用人单位还需支付不低于劳动者本人六个月工资收入的医疗补助费。
- 对于患重病和绝症的劳动者，医疗补助费应相应增加，具体增加幅度可能根据地方规定有所不同。
二、违法解除合同的赔偿
- 若用人单位未按照法定程序解除劳动合同（如未提前通知或未额外支付工资），则属于违法解除。
- 在这种情况下，用人单位需按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
三、特殊情况处理
- 医疗期内：劳动者仍处于医疗期内时，用人单位不得解除劳动合同。若用人单位在医疗期内解除劳动合同，则属于违法解除，需承担相应的法律责任。
- 特殊劳动者保护：
- 从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的，用人单位不得解除劳动合同。
- 因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力的劳动者，用人单位不得解除劳动合同。
- 女职工在孕期、产期、哺乳期等特殊情况下的，用人单位也不得解除劳动合同。
四、实际操作建议
- 用人单位：在解除劳动合同时，应严格遵守法律法规，确保程序的合法性。同时，应妥善保管与劳动者解除劳动合同的相关证据，以备不时之需。
- 劳动者：应了解自己的权益，当用人单位以医疗期满不能上班为由解除劳动合同时，劳动者有权要求用人单位支付经济补偿金和可能的医疗补助费。若用人单位违法解除，劳动者还可以要求用人单位支付双倍赔偿金。必要时，劳动者可寻求法律援助以维护自身合法权益。
在处理此类纠纷时，建议双方先进行友好协商，若协商无果，再考虑通过法律途径解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。