餐饮店扣员工工资是否合法，需根据具体情况判断，以下分情况说明：
无法定事由或违反规定扣除工资：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第十五条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，且不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。除非存在法定允许扣除的情形，如代扣代缴的个人所得税、社会保险费用、法院判决的抚养费、赡养费以及法律、法规规定的其他费用，否则任何形式的扣工资行为都是不合法的。
- 举例：若餐饮店仅因员工迟到几分钟、与顾客发生小争执等轻微原因就扣工资，或者扣除的金额过多，甚至影响到员工的最低生活标准，这种扣除是违法的。
员工造成经济损失的赔偿：
- 如果员工因故意或重大过失给餐饮店造成经济损失，餐饮店有权要求员工进行赔偿。但此赔偿需从员工工资中合理扣除，且每月扣除额不得超过员工当月工资的20%。同时，扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
- 举例：若员工不慎损坏店内贵重设备，给餐饮店带来显著经济损失，在满足上述扣除条件的前提下，从员工工资中适当扣除赔偿款是合法的。
规章制度未依法制定或不合理：
- 即便餐饮店意图通过内部规章制度来设立罚款或扣工资措施以规范员工行为，这些规章制度的制定也必须严格遵循法律程序。这包括与工会或职工代表进行平等协商，并向全体员工公示或告知。若缺失这些法定步骤，或规章制度被认定为不合理、不公正，所设立的罚款或扣工资规定将不具备法律效力，实施即为不合法行为。
- 举例：若餐饮店规定“旷工一天扣三天工资”，这样的规定很可能被劳动仲裁机构或法院认定为不合理、不公正，从而无效。
综合分析与建议：
- 完善内部管理制度：餐饮店应确保规章制度的制定与执行均符合法定程序，明确员工行为规范及违规处理措施，并通过合法途径向员工公示。
- 合理追究赔偿责任：在员工造成经济损失时，餐饮店应依据相关法律法规合理追究赔偿责任，避免过度或不当罚款或扣工资。
- 沟通协商与维权：若员工认为餐饮店扣工资的行为违法，首先应与餐饮店进行沟通协商。协商不成时，员工可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
可能涉及的法律后果：
- 若餐饮店违法扣除员工工资，可能面临劳动监察部门的责令限期支付工资报酬、加付赔偿金等处罚。
- 在劳动争议发生时，违法扣除工资的规定很可能被劳动仲裁机构或法院认定为无效条款，餐饮店需承担相应的法律责任。
总结：
餐饮店扣员工工资并非一概而论地合法或违法，而是需要根据具体情况进行判断。在扣除工资前，餐饮店应确保有明确的法律依据或合理的规章制度作为支撑，并遵循相关的限度和程序。员工也应了解自己的权益，对于无理由或不合法的扣工资行为，要勇于通过合法途径进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。