结论前置：公司合同条款中规定“扣绩效等钱回来才发”的做法，很可能违法，具体是否违法需结合实际情况判断，但多数情况下此类条款因违反劳动法相关规定而无效。以下从不同角度详细分析：
一、从劳动合同法的角度分析
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。用人单位与劳动者订立的劳动合同中，不得违反法律、行政法规的强制性规定。
工资支付义务：用人单位有义务按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果合同中规定“扣绩效等钱回来才发”，实际上是将工资的支付与某种不确定的未来事件（如“钱回来”）相挂钩，这违反了工资支付的确定性和及时性原则。
条款无效情形：根据《劳动合同法》第二十六条，下列劳动合同无效或者部分无效：…（三）违反法律、行政法规强制性规定的。因此，如果此类条款违反了劳动法中关于工资支付的规定，那么该条款应被视为无效。
二、从实际执行的角度分析
绩效扣减的合法性：绩效工资是工资的一部分，其扣减应当有明确的依据和合理的标准。如果公司仅仅以“钱回来”这种模糊且不确定的理由扣减绩效工资，显然缺乏合理性和合法性。
劳动者权益保护：劳动者有权获得与其劳动相对应的报酬。如果公司无故扣减绩效工资，劳动者可以通过法律途径维护自己的合法权益，如向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。
三、具体建议
审查合同条款：首先，劳动者应仔细审查劳动合同中的相关条款，特别是关于工资支付和绩效扣减的部分。如果发现存在违法或不合理之处，应及时与公司沟通协商修改。
保留证据：如果公司确实存在无故扣减绩效工资的行为，劳动者应保留好相关证据，如工资条、银行流水、劳动合同等，以便在需要时证明自己的权益。
寻求法律帮助：如果与公司沟通无果，劳动者可以寻求法律帮助，如向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。在维权过程中，劳动者可以咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
举例说明：假设某公司与员工签订的劳动合同中规定，员工的绩效工资将在公司收到某笔款项后发放。然而，该笔款项的到账时间并不确定，且与公司是否发放绩效工资无直接关联。在此情况下，该条款显然违反了工资支付的确定性和及时性原则，应被视为无效。如果公司因此扣减员工的绩效工资，员工有权通过法律途径维护自己的合法权益。
综上所述，公司合同条款中规定“扣绩效等钱回来才发”的做法很可能违法。如果你遇到此类情况，建议仔细审查合同条款、保留好相关证据，并及时寻求法律帮助。