单位在修改薪酬制度时，确实需要经过一定的程序，并且这些程序应当充分考虑到员工的权益和参与。以下是对这一问题的详细解答：
首先，根据相关法律法规，用人单位在制定或修改涉及劳动者切身利益的规章制度，包括薪酬制度时，应当遵循一定的程序和规定。这主要是为了保障劳动者的知情权、参与权和表达权，确保制度的公平性和合理性。
具体来说，修改薪酬制度应当经过以下程序：
讨论与提出方案：单位应当组织职工代表大会或者全体职工进行讨论，就薪酬制度的修改提出具体的方案和意见。这一步骤旨在收集员工的反馈和建议，确保修改方案能够充分反映员工的利益和需求。
平等协商确定：在提出方案和意见后，单位应当与工会或者职工代表进行平等协商，共同确定最终的薪酬制度修改方案。这一步骤强调了单位与员工之间的平等地位，确保修改方案是在双方充分沟通和协商的基础上达成的。
公示或告知：修改后的薪酬制度应当进行公示，或者以其他方式告知劳动者。这是为了确保员工能够及时了解并理解新的薪酬制度，从而保障其合法权益。
员工确认与签字：虽然直接的法律条文可能并未明确要求员工在修改后的薪酬制度上签字确认，但为了确保制度的执行力和员工的认可度，单位可以要求员工以书面形式确认其了解并同意新的薪酬制度。这一步骤可以作为双方之间的一种约定，增强制度的约束力。
综上所述，单位在修改薪酬制度时，确实需要经过员工的参与和协商，确保修改方案能够充分反映员工的利益和需求，并且应当进行公示或告知，以保障员工的知情权。这样的程序不仅符合法律法规的要求，也有助于增强员工对单位的信任感和归属感。