要证明用人单位在工资条中未列明但已实际支付加班费的情况（实际上更严谨的表述应为“证明工资中不包含加班费或用人单位未支付加班费”），我们需要从多个维度进行综合论证，并确保所有证据均合法有效。以下是一个详细且有条理的解答：
一、理解加班费的法律基础
首先，根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，加班费是劳动者在超出正常工作时间工作时应得的额外报酬。具体标准如下：
- 延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；
- 休息日工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；
- 法定休假日工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
二、收集并分析关键证据
劳动合同及公司规章制度：
- 仔细查阅劳动合同，确认工资构成中是否明确区分了基本工资和加班费，或是否有“包含加班费”的表述。
- 检查公司规章制度，特别是《薪酬管理制度》，看是否有关于工资结构和加班费计算方式的明确规定，并确保这些制度已向劳动者公示且合法有效。
工资支付记录：
- 分析工资条明细，确认是否有“加班费”这一项目，或加班费是否是单独列出、额外发放的。如果工资条上未列明加班费，且其他组成部分与劳动合同约定相符，这有助于证明工资不包含加班费。
- 查看银行工资流水，确认每月工资发放金额是否相对固定，是否与劳动合同约定的工资构成相符，并关注是否有单独的加班费入账记录。
加班证据：
- 收集加班审批记录，如《加班申请表》，确认加班日期、时长、原因及上级领导的审批签字。特别注意是否有提及加班费已包含在工资中的内容。
- 通过考勤记录确认员工是否存在大量加班情况，并结合工资发放记录分析工资是否因加班而相应增加。如果考勤记录显示存在大量加班但工资并未明显增加，这有助于推断工资不包含加班费。
证人证言：
- 收集同事的证言，证明公司的工资发放惯例、加班情况以及加班费的发放方式。虽然同事证言的证明力相对较弱，但结合其他证据可以形成有力的证据链。
三、对比工资总额与应得加班费
计算应得加班费：
- 根据加班时间和法定加班费率（平时加班1.5倍、周末加班2倍、法定节假日加班3倍），计算出应得的加班费总额。
对比工资总额：
- 将计算出的应得加班费与实际收到的工资总额进行对比。如果发现实际工资总额明显低于应得工资总额（包括基本工资和加班费），那么可以进一步证明实际工资中未包含加班费。
四、采取法律途径维权
如果经过上述步骤后，仍然无法确定实际工资中是否包含加班费，或者用人单位拒绝承认并支付加班费，劳动者可以采取以下法律途径维权：
向劳动监察部门投诉：
- 向当地劳动监察部门提交相关证据材料，请求其对用人单位进行调查和处理。
申请劳动仲裁：
- 向劳动争议仲裁委员会提起仲裁申请，要求用人单位支付拖欠的加班费及相应的经济补偿金。在仲裁过程中，需要提供充分的证据证明自己的主张。
提起诉讼：
- 如果对仲裁结果不满意，还可以向人民法院提起诉讼，通过司法程序维护自己的合法权益。
五、行动建议
- 咨询专业律师：在收集证据或理解法律方面遇到困难时，应及时咨询专业的劳动法律师。律师可以提供具体的法律建议并制定策略来帮助证明工资不包含加班费。
- 正式提出异议：如果发现工资确实未包含加班费或用人单位未支付加班费，应及时与雇主沟通并提出异议。提供收集到的证据并要求雇主进行更正。如果雇主拒绝更正，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
综上所述，通过综合运用劳动合同、工资支付记录、公司规章制度、加班证据、证人证言以及法律法规等多方面的证据和依据，我们可以有效地证明工资中不包含加班费或用人单位未支付加班费，并依法维护自己的合法权益。