公司辞退员工时仅发放工资的80%，这一做法是否合法，需分情况讨论：
若公司辞退行为合法，且符合工资支付规定：
- 根据《工资支付暂行规定》等相关法律法规，用人单位在特定情况下（如员工严重违反公司规章制度、被依法追究刑事责任等）可以合法辞退员工。但即便如此，公司也需按照劳动合同或国家规定，全额支付员工应得的工资，除非有明确的法律规定或合同约定可以扣除部分工资。
- 若公司仅因合法辞退就擅自扣除20%的工资，这一做法是不合法的。员工有权要求公司全额支付工资，并可以通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
若公司辞退行为违法：
- 如果公司辞退员工的行为本身就不合法（如无正当理由辞退、未提前通知等），那么公司不仅需要全额支付员工工资，还可能需要支付经济补偿金或赔偿金。
- 在这种情况下，公司仅支付80%的工资更是明显违法，员工有权要求公司支付全额工资，并可能要求额外的经济补偿或赔偿。
特殊情况下的工资扣除：
- 当然，也存在一些特殊情况，如员工因个人原因给公司造成损失，公司可以根据合同约定或法律规定扣除部分工资作为赔偿。但这种情况下的扣除比例和条件都有严格限制，且必须合法合规。
- 若公司未经合法程序或未满足扣除条件就擅自扣除工资，这一做法同样是不合法的。
法律建议：
- 如果你遇到公司辞退且仅支付80%工资的情况，首先应与公司沟通，了解具体原因和依据。
- 如果公司无法提供合法合理的解释或依据，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司全额支付工资，并可能要求额外的经济补偿或赔偿。
- 在整个过程中，保留好相关证据（如劳动合同、工资条、辞退通知等）是非常重要的，以便在需要时提供证明。
可能后果：
- 如果公司坚持不支付全额工资，且你的诉求合理合法，那么劳动监察部门或劳动仲裁机构可能会责令公司限期支付，并可能对公司进行处罚。
- 如果公司仍不履行支付义务，你还可以通过法院诉讼等途径进一步维护自己的权益。
总之，公司辞退员工时仅发放工资的80%是否合法，取决于辞退行为的合法性和工资扣除的合理性。如果你遇到这种情况，建议及时咨询专业律师或相关机构，以便更好地维护自己的合法权益。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供详细的法律解答。