公司只发80%工资是否合法，需视具体情况而定。以下是对此问题的详细分析：

1. 不合法的情况：

   • 无故扣发工资：根据《劳动法》和相关规定，公司应足额支付劳动者工资，不得无故克扣。若劳动合同约定了全额工资，而公司未经劳动者同意只发放80%，则违反了法律规定。此时，劳动者有权要求公司补发差额，并可通过协商、投诉劳动监察部门或申请劳动仲裁等方式维权。
   • 以不正当理由减薪：若公司以歧视、报复等不正当理由降低员工工资至80%，同样违法。劳动者应依法追究公司责任。

2. 合法的特殊情形：

   • 双方协商一致并书面约定：在公司经营困难等特殊情况下，若公司与劳动者经协商一致，并签订书面协议明确约定在一定时期内只发放80%工资，则该行为合法。
   • 试用期工资规定：根据《劳动合同法》第二十条，劳动者在试用期的工资不得低于本单位相同岗位最低档工资或劳动合同约定工资的80%，且不得低于用人单位所在地的最低工资标准。因此，若员工处于试用期，且公司按照规定发放工资，则是合法的。
   • 特定情况下的减薪：如公司因不可抗力等法定事由导致经营困难，经与工会或全体员工协商后，可以合理降低工资发放比例，但降低后的工资需满足不低于当地最低工资标准的条件。
   • 符合相关扣除规定：在特定情况下，公司可依法扣除部分工资，如员工违反公司规章制度给公司造成经济损失时的赔偿扣除，但扣除后的工资余额一般不得低于当地最低工资标准。

综上所述，公司只发80%工资是否合法，需根据具体情况判断。若劳动者认为公司行为违法，可采取与公司协商、保留证据、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等措施维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。