结论：在签订合同且货款已收，但没有实物发货记录的情况下，是否可以开票需分情况讨论，主要取决于交易的真实性、合同约定以及税务合规性。以下从不同角度进行分析：

1. 交易真实性与合同约定

• 若交易真实存在：即使没有实物发货记录（如因物流系统故障、未及时录入等），只要双方对交易内容（如货物名称、数量、价格等）无争议，且合同中未明确约定“以发货记录为开票前提”，则卖方仍可依法开具发票。根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。
• 若交易存在争议：如买方主张未收到货物或货物与合同不符，而卖方无法提供发货记录等证据证明交易已完成，此时开票可能引发税务风险（如被认定为虚开发票）。建议卖方先通过补充证据（如物流单号、签收记录、沟通记录等）证明交易真实性，再行开票。

2. 税务合规性

• 增值税专用发票：若需开具增值税专用发票，必须确保交易真实且符合“三流一致”（即货物流、资金流、发票流一致）。若缺乏发货记录，可能被税务机关质疑交易真实性，进而面临补税、罚款等风险。
• 普通发票：普通发票的开具要求相对宽松，但仍需以真实交易为基础。若交易真实但缺乏发货记录，建议卖方在发票备注栏注明“货物已交付但未录入系统”等说明，并留存相关证据备查。

3. 合同条款的补充作用

• 若合同中明确约定“以发货记录为开票前提”或“买方确认收货后卖方开具发票”，则卖方需先满足合同条件再行开票。否则，买方可能以“未满足开票条件”为由拒绝付款或要求延迟开票。
• 建议双方在合同中补充约定开票时间、条件及违约责任，以避免纠纷。例如：“卖方应在收到货款后5个工作日内开具发票，买方应在收到发票后3个工作日内确认；若因卖方原因导致发票开具延迟，买方有权暂缓支付剩余货款。”

4. 法律风险与建议

• 风险点：若卖方在未发货或交易不真实的情况下开具发票，可能构成《刑法》第二百零五条之一的“虚开发票罪”，面临刑事处罚；即使不构成犯罪，也可能被税务机关处以罚款、没收违法所得等行政处罚。
• 建议：
  1. 卖方应立即补充发货记录或通过其他方式证明交易真实性（如物流单号、签收单、沟通记录等）；
  2. 若无法补充证据，建议与买方协商延迟开票或部分开票，并签订补充协议明确双方权利义务；
  3. 若买方坚持要求立即开票，卖方可要求买方出具书面承诺（如“确认已收到货物并同意卖方开具发票”），以降低法律风险。

总结：是否可以开票需结合交易真实性、合同约定及税务合规性综合判断。若交易真实且合同无特殊约定，卖方可依法开票；若存在争议或缺乏证据，建议先补充证明材料或协商解决。如有进一步疑问，可直接向我咨询。