结论：在上班途中受伤且对方全责的情况下，若对方已经进行了赔偿，公司是否可以拒赔需根据具体情况来判断，一般情况下，若符合工伤认定条件，公司仍需承担相应的工伤保险责任，不能因对方已赔偿而拒赔。以下从不同角度进行分析：
一、工伤认定与赔偿的独立性
工伤认定：根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。这意味着，只要符合这一条件，职工就有权享受工伤保险待遇，无论事故责任方是否已经进行了赔偿。
赔偿的独立性：工伤赔偿与交通事故赔偿是两种不同的法律关系，它们之间并不互相排斥。职工在获得交通事故赔偿后，仍然有权根据工伤保险的规定，向公司主张工伤保险待遇。这是因为工伤保险是一种社会保险制度，其目的在于保障职工在工作中或因工作原因受到伤害时能够获得必要的医疗救治和经济补偿。
二、公司拒赔的合法性分析
一般情况：在对方全责且已经进行了赔偿的情况下，公司不能简单地以对方已赔偿为由拒绝承担工伤保险责任。因为工伤保险责任是公司作为用人单位应当承担的法定义务，与事故责任方的赔偿是两个独立的法律关系。
特殊情况：如果职工在获得交通事故赔偿后，其实际获得的赔偿总额已经超过了其因工伤应得的工伤保险待遇总额，那么在这种情况下，公司可能会根据具体情况与职工协商，对超出部分进行一定的调整或抵扣。但这种情况并不常见，且需要具体协商和法律程序来确定。
三、法律建议
及时申请工伤认定：在发生工伤事故后，职工应及时向公司报告，并按照公司的要求或相关法律法规的规定，及时申请工伤认定。这是享受工伤保险待遇的前提和基础。
保留相关证据：职工应保留好与工伤事故相关的所有证据，包括交通事故认定书、医疗证明、费用单据等。这些证据在申请工伤认定和主张工伤保险待遇时都将起到重要作用。
与公司协商或寻求法律援助：如果公司在职工申请工伤保险待遇时拒绝承担责任或提出不合理的要求，职工可以与公司进行协商，或者寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的合法权益。
总结来说，在上班途中受伤且对方全责的情况下，若符合工伤认定条件，公司仍需承担相应的工伤保险责任。职工在获得交通事故赔偿后，仍然有权向公司主张工伤保险待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。