关于“老板申请员工出厂是否合法”的问题，这实际上涉及到用人单位对员工的管理权限以及员工权益的保护，我们需要从多个法律角度来综合分析。

首先，我们要明确的是，用人单位（包括老板）在管理员工时，必须遵守国家法律法规，尊重员工的合法权益，不得侵犯员工的人身自由、人格尊严等基本权利。这是所有管理行为的前提和基础。

接下来，我们针对“申请员工出厂”这一具体行为进行分析：

1. 如果“出厂”是指员工正常下班或因工作需要暂时离开工厂：

   • 这种情况下，员工有权自由进出工厂，老板或用人单位无权非法限制。员工应按照工厂的规章制度和工作时间安排进行出入。

2. 如果“出厂”是指老板单方面决定让员工离开工厂，且这种离开并非基于员工自愿或合法原因：

   • 这可能涉及到违法解除劳动合同的问题。根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位解除劳动合同必须基于合法、合理的理由，如员工严重违反规章制度、严重失职等，并且需要遵循一定的程序。
   • 如果老板无正当理由或违反法定程序让员工“出厂”，即违法解除劳动合同，员工有权要求用人单位支付违法解除劳动合同的赔偿金，并可以通过劳动仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。

3. 关于“严重违反规章制度”的界定：

   • 这是一个相对复杂且需要具体案例具体分析的问题。一般来说，判断员工行为是否“严重违反规章制度”需要考虑行为的性质、情节、后果以及是否对用人单位造成了重大损害等因素。
   • 例如，在某个案例中，员工私下称领导为“老太太”被公司辞退，但法院最终认为该行为并未达到严重违反规章制度的程度，因为该言论并不具有贬低或侮辱性的含义，且影响范围有限。

综上所述，老板申请员工出厂是否合法，取决于具体情境和原因。如果老板的行为违反了国家法律法规或侵犯了员工的合法权益，那么这种行为就是不合法的。员工在面对此类情况时，应了解自己的权益，并在必要时寻求法律援助或通过劳动仲裁、诉讼等途径维护自己的合法权益。