一般情况下，用人单位直接以不打扫卫生为由扣工资是不合法的，但存在例外情形。以下从不同角度进行分析：

常规情形：扣工资缺乏依据，不合法

工资是劳动者付出劳动后应得的报酬，非因法定或约定事由，用人单位不得随意克扣。若劳动合同或公司的规章制度中，并未明确将不打扫卫生作为可以扣除工资的情形，那么用人单位擅自扣除工资就缺乏合法依据。例如，小李在一家公司工作，公司从未在劳动合同或规章制度里提及卫生打扫与工资扣除的关系，却因小李某天未打扫办公区域卫生而扣了他部分工资，这种做法就是不合法的。

例外情形：规章制度有规定且合理，可能合法

如果用人单位的规章制度中明确规定了卫生要求以及相应的奖惩措施，并且已经向劳动者进行了公示或者告知，那么情况就有所不同。比如，公司规章制度里写明“办公区域卫生不达标，每次扣除当月工资的5%”，并且该规章制度在员工入职时就已经明确告知员工，员工也签字确认知晓。在这种情况下，如果劳动者违反了卫生规定，用人单位扣除工资可能就具有一定的合法性。不过，即便规章制度有规定，扣除工资的额度也应当合理，不能过度。一般来说，扣除的工资金额不应超过劳动者当月工资的20%，并且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。

劳动者应对措施

劳动者遇到用人单位仅凭不打扫卫生就随意扣工资的情况，可以先与用人单位进行沟通，了解扣工资的具体依据。如果认为用人单位的做法不合理，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门会依法对用人单位的违法行为进行查处。劳动者也可以申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，劳动者需要准备相关的证据，如劳动合同、工资条、扣工资的通知等，以证明用人单位的违法行为。

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