结论前置：上班卫生没弄干净扣钱是否合法，取决于公司是否有明确且合法的规章制度作为依据，以及扣钱行为是否符合相关法律法规。在大多数情况下，公司以此为由直接扣钱是不合法的。
一、不合法的情况及原因
缺乏法律依据：
- 根据我国法律，罚款是一种行政处罚权，只有具备行政处罚权的行政机关或法律授权的组织才有权实施。公司作为民事主体，并不具备这样的权力。因此，公司随意对劳动者进行罚款，包括因卫生问题扣钱，是违法的。
违背劳动合同关系本质：
- 劳动者与用人单位之间是基于劳动合同建立的平等民事主体关系。用人单位不能未经法定程序和约定，随意扣除劳动者的工资。工资是劳动者通过劳动获得的报酬，用人单位有义务按照劳动合同约定足额支付。
规章制度不合法或未公示：
- 即使公司试图通过内部规章制度来规定此类扣款，该规章制度也必须满足严格的法律要求方能有效。具体来说，规章制度的内容必须合法合理，不能违反法律法规的强制性规定，且处罚措施要符合公平原则；制定过程需经过民主程序，如职工代表大会讨论，并与工会或职工代表平等协商确定；最后，规章制度还需向全体劳动者公示，确保其知晓并理解相关规定。如果单位的规章制度未能满足上述条件，那么以此为依据扣减工资同样是违法的。
二、可能合法的情况及条件
规章制度明确规定且合理：
- 如果公司在依法制定的规章制度中明确规定了卫生不达标的具体情形及相应的罚款措施，并且该规章制度制定程序合法（如经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并进行公示或告知劳动者），同时罚款金额合理且不影响劳动者基本生活，那么公司依据此规章制度进行的罚款可能被认定有效。但这种情况较为特殊，且需要满足多个条件。
造成公司实际损失：
- 若因卫生问题导致公司遭受实际经济损失，如客户投诉、业务受损等，公司可以要求劳动者赔偿损失。但赔偿需遵循一定程序，如先进行损失评估，经劳动者确认后从工资中扣除，且每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这种情况下，扣钱并非作为罚款，而是作为赔偿，且需严格遵守相关程序和规定。
三、公司的合法处理方式及员工权益保护
公司的合法处理方式：
- 如果员工违反公司卫生规定，公司应采取合法手段进行处理，如进行批评教育、依据劳动合同中的约定扣发奖金或其他福利等。在严重情况下，可以依据劳动合同法的相关规定解除劳动合同，但需确保解除合同的合法性和合理性。
员工权益保护：
- 员工在面对公司的不合法罚款时，有权采取以下措施维护自己的合法权益：与公司进行沟通协商，要求其说明罚款依据；向劳动监察部门投诉；申请劳动仲裁；如对仲裁结果不满，可在规定时间内向法院提起诉讼。在整个维权过程中，员工应注意收集并保存好相关证据材料，如劳动合同、工资条、考勤记录以及与单位关于扣款问题的沟通记录等。
四、总结与建议
总结：上班卫生没弄干净扣钱是否合法，取决于公司是否有明确且合法的规章制度作为依据，以及扣钱行为是否符合相关法律法规。在大多数情况下，公司以此为由直接扣钱是不合法的。员工应了解自己的权益，并在面对不合法罚款时积极采取措施维护自身权益。
建议：作为员工，应仔细阅读并了解公司的规章制度，特别是与工资扣减相关的部分。如果公司试图以卫生问题为由扣钱，员工有权要求公司说明扣款的依据和理由，并核实该依据是否合法合规。如果员工认为公司的扣款行为不合法或不合理，可以通过沟通协商、投诉、仲裁或诉讼等方式来维护自己的合法权益。同时，员工也应遵守公司的卫生规定，共同维护良好的工作环境。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。