结论前置：单位以卫生没打扫干净为由直接扣工资，一般情况下是不合法的。不过，具体是否合法还需根据单位是否有合法有效的规章制度以及扣钱行为的合理性来判断。
一、无合法规章制度或扣钱不合理时，不得扣钱
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第九十一条，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者工资。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，受到法律的严格保护。
- 《工资支付暂行规定》也明确指出，除非符合法定的扣除情形（如代扣代缴个人所得税、社会保险费用等），否则任何单位或个人均不得擅自扣减工资。卫生没打扫干净显然不属于这些法定扣除情形。
规章制度制定的合法性：
- 即便单位试图通过内部规章制度来规定此类扣款，该规章制度也必须满足严格的法律要求。规章制度的内容必须合法合理，不能违反法律法规的强制性规定，且处罚措施要符合公平原则。
- 制定过程需经过民主程序，如职工代表大会讨论，并与工会或职工代表平等协商确定。规章制度还需向全体劳动者公示，确保其知晓并理解相关规定。如果单位的规章制度未能满足上述条件，那么以此为依据扣减工资同样是违法的。
公司管理的合理性：
- 公司应通过明确职责、合理沟通等方式来管理员工的卫生行为，而非直接采取扣钱的处罚措施。若员工行为确实造成经济损失，公司应依法要求员工赔偿，并确保赔偿数额和方式符合法律法规规定。
二、有合法规章制度且扣钱合理时，可以扣钱（但需谨慎）
特殊情况说明：
- 在极少数情况下，如果单位制定了合法有效的规章制度，明确规定了员工卫生管理职责以及相应的奖惩措施，并且扣钱标准合理（如扣除金额适度，不会导致员工工资低于当地最低工资标准），那么在员工确实未履行卫生职责的情况下，单位有权按照规章制度进行适当扣钱。
- 但这种情况非常特殊，且需要满足诸多严格条件，实践中较为少见。
实际操作建议：
- 即便单位有这样的规章制度，也建议谨慎使用扣钱措施。因为扣钱可能引发员工的不满和抵触情绪，影响工作氛围和团队凝聚力。
- 单位可以考虑采用其他更温和的管理方式，如提醒、警告、培训等，来引导员工履行卫生职责。
三、劳动者的维权途径
协商：
- 劳动者可以尝试与用人单位进行协商，要求其说明扣款的依据并返还不合理扣除的工资。
投诉：
- 若协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，由其对用人单位的工资支付情况进行监督检查并责令改正违法行为。
仲裁与诉讼：
- 劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，甚至向人民法院提起诉讼来维护自己的合法权益。
四、建议与总结
对单位的建议：
- 单位应严格遵守相关法律法规的规定，确保员工的合法权益得到充分保障。在制定规章制度时，应确保内容的合法性和合理性，并经过民主程序制定和公示。
- 在管理员工时，应采用合法、合理、温和的方式，避免引发不必要的纠纷和矛盾。
对劳动者的建议：
- 劳动者应了解自己的合法权益和维权途径，在面对不合法的扣款行为时，要勇敢站出来维护自己的权益。
- 在日常工作中，也应积极履行自己的职责和义务，避免给单位造成不必要的损失和麻烦。
总结：单位以卫生没打扫干净为由直接扣工资，一般情况下是不合法的。劳动者在面对此类情况时，应依法维护自己的权益；而单位也应严格遵守相关法律法规的规定，确保员工的合法权益得到充分保障。如果你还有其他关于劳动工伤（工资福利）方面的问题，可以直接向我咨询。