首先，我们需要明确的是，你的实际工资和合同上的底薪之间存在差异，这并不罕见，但关键是要确保你的权益不受损害，且加班费计算方式明确且合法。

1. 加班费计算基础：加班费通常是基于底薪（即基本工资）来计算的，而不是基于你口头约定的到手工资。在你的情况下，如果合同上明确写明了底薪为2000元，那么加班费就应当以此为基础进行计算。

2. 加班费计算标准：

   • 平时加班（即工作日延长工作时间）：通常是底薪的1.5倍。
   • 休息日加班（即周六、周日或法定节假日以外的其他休息日）：通常是底薪的2倍。
   • 法定节假日加班：通常是底薪的3倍。

3. 实际到手工资与合同底薪的差异：你提到面试时说的是5500元到手工资，但合同上写的是2000元底薪。这里可能存在几种情况：

   • 绩效、奖金或津贴：剩余的部分可能以绩效、奖金、津贴等形式发放，这些通常不计入加班费计算基数。
   • 口头约定与书面合同不一致：如果面试时的承诺与合同内容不符，建议你与雇主沟通，明确实际工资构成，并确保这一构成在合同中有所体现，以保障你的权益。

4. 建议：

   • 仔细阅读合同：确保你完全理解合同中的条款，特别是关于工资、加班费和福利待遇的部分。
   • 与雇主沟通：如果有任何疑问或不明确的地方，及时与雇主沟通，要求解释清楚。
   • 保留证据：如果雇主在面试时的承诺与合同内容不符，且沟通无果，建议你保留相关证据（如面试记录、聊天记录等），以备不时之需。

总之，加班费是基于合同上的底薪来计算的，而不是基于口头约定的到手工资。如果你的实际工资与合同底薪存在差异，建议与雇主明确工资构成，并确保你的权益得到保障。如有任何法律问题，欢迎随时向我咨询。