即使工资由老板娘发放，也不影响劳动关系的认定。在劳动仲裁中，若公司不认可与劳动者之间的劳动关系，即便工资是由老板娘的账户发放，也不必然导致劳动关系不成立。具体分析如下：

1. 劳动关系的法律定义：

   • 根据《劳动合同法》第七条，用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。劳动关系的存在并不依赖于工资发放者的身份，而是基于用人单位对劳动者的实际用工行为。

2. 老板娘发放工资的法律意义：

   • 老板娘作为公司股东或实际管理者，其发放工资的行为在多数情况下应被视为代表公司的行为，而非个人行为。
   • 除非公司有明确证据证明老板娘发放工资是个人行为，且该行为与公司的用工行为无关，否则应认定该行为是公司行为的一部分。

3. 劳动关系的证明：

   • 除了工资发放记录外，劳动者还可以通过其他证据来证明劳动关系的存在，如工作证、服务证、考勤记录、其他劳动者的证言等。
   • 这些证据可以相互印证，形成完整的证据链，以证明劳动者与用人单位之间的劳动关系。

4. 劳动仲裁的考量因素：

   • 在劳动仲裁中，仲裁员会综合考虑所有相关证据，包括工资发放记录、工作证、考勤记录等，以及双方当事人的陈述和辩解，来判定劳动关系的存在与否。
   • 因此，即便工资是由老板娘发放，只要其他证据能够证明劳动关系的存在，仲裁员仍会认定劳动关系成立。

综上所述，即便工资由老板娘发放，也不影响劳动关系的认定。在劳动仲裁中，劳动者应尽可能提供全面的证据来证明劳动关系的存在，以维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。