结论前置：事业单位人员档案中同时存在自动离职证明和候补的解除劳动关系证明时，其视同工龄的计算需根据具体情况而定，一般原则上自动离职前的工龄不能视同缴费，但也要考虑社保缴纳、政策规定及单位实践等因素。

详细分析：

1. 自动离职的影响：

   • 根据原《人事部关于机关事业单位工作人员辞职辞退及自动离职参加工作后工作年限计算问题的复函》（人办函〔1998〕101号），自动离职人员的工龄从重新录用之日起计算。这意味着，如果档案中有自动离职证明，那么自动离职前的工龄通常不能连续计算，也就不能视同缴费年限。

2. 候补解除劳动关系的影响：

   • 候补的解除劳动关系证明可能表明，在自动离职之后，员工与单位之间又有了一种新的劳动关系解除方式。但这并不改变自动离职前工龄不能视同缴费的原则。
   • 如果候补的解除劳动关系证明中包含了关于工龄连续计算或视同缴费年限的特殊约定，并且该约定符合当时的政策规定，那么这部分工龄有可能被视同缴费。但这需要具体查看证明内容，并结合相关政策进行判定。

3. 社保缴纳情况：

   • 社保缴纳记录是计算工龄和视同缴费年限的重要依据。如果员工在自动离职前已经按规定缴纳了社保，那么这部分缴纳记录可以作为其工龄和视同缴费年限的证明。
   • 但需要注意的是，即使社保缴纳记录存在，如果自动离职前的工龄不能连续计算，那么这部分缴纳记录也可能无法直接用于视同缴费年限的计算。

4. 政策规定及单位实践：

   • 不同时期的政策规定可能对工龄和视同缴费年限的计算产生不同影响。因此，在处理这类问题时，需要查阅相关时期的政策文件，了解具体规定。
   • 同时，单位实践也是影响工龄和视同缴费年限计算的重要因素。如果单位在员工自动离职后采取了特殊措施，如补缴社保、认定工龄等，那么这些措施可能影响最终的计算结果。

总结与建议：

• 在处理事业单位人员档案中同时存在自动离职证明和候补的解除劳动关系证明时的视同工龄问题时，应综合考虑多种因素，包括自动离职的影响、候补解除劳动关系的影响、社保缴纳情况、政策规定及单位实践等。
• 如果员工对此类问题存在疑问或争议，建议其及时咨询相关部门或专业人士，以获取准确的信息和解决方案。