在机关事业单位工作11年，一般情况是存在劳动关系的。以下从多个角度为你详细分析：

劳动关系认定的一般原则

劳动关系是指劳动者与用人单位之间，依法所确立的劳动过程中的权利义务关系。根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动关系的认定主要基于以下几个方面：

1. 主体资格：劳动者和用人单位需具备相应的主体资格。在机关事业单位工作的员工，通常具备劳动者的主体资格，而机关事业单位则具备用人单位的主体资格。
2. 劳动管理：劳动者需接受用人单位的劳动管理，遵守用人单位的规章制度。在机关事业单位工作的员工，一般需要遵守单位的考勤、工作纪律等规定，接受单位的管理。
3. 劳动报酬：劳动者需从用人单位获得劳动报酬。机关事业单位通常会按照国家规定或单位制度，向员工支付工资、奖金等劳动报酬。
4. 业务组成：劳动者提供的劳动是用人单位业务的组成部分。机关事业单位的员工所从事的工作，通常是单位职能的一部分，满足这一条件。

机关事业单位的特殊性

机关事业单位在劳动关系认定上可能存在一些特殊性，但并不影响劳动关系的存在：

1. 编制问题：机关事业单位的员工可能分为编制内和编制外。无论编制内还是编制外，只要员工与单位之间存在上述劳动关系认定的要素，即可认定存在劳动关系。编制内员工通常享有更稳定的职业保障和福利待遇，但这并不改变其与单位之间的劳动关系性质。
2. 聘用合同：机关事业单位可能通过签订聘用合同的方式来明确双方的权利义务。聘用合同是劳动关系的一种表现形式，只要合同内容合法、有效，且双方实际履行了合同义务，即可认定存在劳动关系。

实际案例与法律适用

在实际案例中，法院通常会根据上述劳动关系认定的原则，结合具体案情来判定是否存在劳动关系。例如，如果员工在机关事业单位工作了11年，期间一直接受单位的管理，从事单位安排的工作，并从单位获得劳动报酬，那么法院很可能会认定该员工与单位之间存在劳动关系。

注意事项与建议

1. 保留证据：为了证明劳动关系的存在，员工应保留好与单位签订的聘用合同、工资单、考勤记录等相关证据。
2. 及时维权：如果员工与单位之间发生劳动争议，如工资拖欠、解除劳动合同等，员工应及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
3. 咨询专业意见：由于劳动关系认定可能涉及复杂的法律问题，员工在遇到相关问题时，可以向专业律师咨询，以获取更准确的法律意见和帮助。

综上所述，在机关事业单位工作11年，一般情况是存在劳动关系的。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。