结论：离职时被审计出来虚假报销2000元，公司以此为由不给补偿是否合法，需分情况讨论。
1. 虚假报销的性质与后果
虚假报销属于违反公司规章制度或职业道德的行为，甚至可能构成欺诈。根据《劳动合同法》的相关规定，员工严重违反公司规章制度的，公司有权解除劳动合同，且无需支付经济补偿。但这里的关键在于“严重违反”的界定，以及公司规章制度是否明确规定了虚假报销为严重违纪行为。
若公司规章制度明确规定虚假报销为严重违纪行为，且该制度已向员工公示或告知：在此情况下，公司以虚假报销为由解除劳动合同，并拒绝支付经济补偿，是合法的。
若公司规章制度未明确规定虚假报销为严重违纪行为，或该制度未向员工公示或告知：公司可能无法直接以虚假报销为由解除劳动合同并拒绝支付经济补偿。但公司仍可能依据《劳动合同法》的其他条款，如员工严重失职、营私舞弊给公司造成重大损害等，来解除劳动合同。不过，这需要公司证明虚假报销行为给公司造成了重大损害，且这一损害与员工的虚假报销行为有直接因果关系。
2. 经济补偿的支付条件
经济补偿的支付通常与劳动合同的解除原因有关。根据《劳动合同法》的规定，员工因公司过错（如未提供劳动条件、未及时支付劳动报酬等）而解除劳动合同的，公司应支付经济补偿。而员工因自身过错（如严重违反公司规章制度、被依法追究刑事责任等）被公司解除劳动合同的，公司则无需支付经济补偿。
3. 实际操作建议
对于员工而言：如果公司以虚假报销为由拒绝支付经济补偿，员工可以首先查阅公司规章制度，了解虚假报销是否被明确列为严重违纪行为。同时，员工也可以收集相关证据，证明自己的虚假报销行为并未给公司造成重大损害，或者公司并未因此遭受实际损失。
对于公司而言：如果公司打算以虚假报销为由解除劳动合同并拒绝支付经济补偿，那么公司需要确保公司规章制度中明确规定了虚假报销为严重违纪行为，并且该制度已经向员工公示或告知。此外，公司还需要收集充分证据，证明员工的虚假报销行为确实构成了严重违反公司规章制度或给公司造成了重大损害。
4. 可能的法律后果
如果公司违法解除劳动合同：员工有权要求公司继续履行劳动合同或者支付赔偿金。赔偿金的计算标准通常为经济补偿的两倍。
如果员工虚假报销行为构成犯罪：如诈骗罪等，员工还可能面临刑事责任的追究。
总结与建议：离职时被审计出来虚假报销2000元，公司以此为由不给补偿是否合法，需根据具体情况判断。如果公司规章制度明确规定且已公示或告知，且虚假报销行为构成严重违反或给公司造成重大损害，则公司行为合法；否则，公司可能仍需支付经济补偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。