调整薪酬后加班费少两千是否合理，这并不能一概而论，需要结合具体情况来分析。以下是从不同角度为你进行的详细分析：
一、法律角度
加班费计算依据：
- 根据《劳动法》及相关规定，加班费通常是根据劳动者的小时工资或日工资，按照一定比例（如平时加班1.5倍、周末加班2倍、法定节假日加班3倍）来计算的。
- 如果调整薪酬后，你的基本工资发生了变化，那么加班费也会相应调整。但调整后的加班费是否合理，需要看你调整后的基本工资是否符合劳动合同或相关法律法规的规定。
薪酬调整合法性：
- 薪酬调整需要双方协商一致，并签订书面的变更协议。如果公司单方面调整你的薪酬，且未与你协商一致，那么这种调整可能是不合法的。
- 即使双方协商一致调整了薪酬，也需要确保调整后的薪酬不低于当地的最低工资标准，且加班费的计算基数（即基本工资）也要合理。
二、实际情况角度
薪酬结构变化：
- 有些公司可能会通过调整薪酬结构（如将部分基本工资转为绩效工资）来影响加班费的计算。这种情况下，你需要仔细审查薪酬结构的变化，确保加班费的计算基数没有不合理地降低。
- 如果薪酬结构的变化导致加班费计算基数大幅降低，从而使得加班费减少两千，那么这种调整可能是不合理的。
加班时间变化：
- 加班费的多少也与加班时间有关。如果调整薪酬后，你的加班时间减少了，那么加班费相应减少也是合理的。
- 但如果加班时间没有变化，而加班费却因为薪酬调整而大幅减少，那么这种调整就可能存在问题。
三、建议与行动
审查劳动合同和薪酬调整协议：
- 仔细审查你的劳动合同和薪酬调整协议，确保薪酬调整是合法且合理的。
- 如果发现薪酬调整存在问题，如未协商一致、调整后的薪酬低于最低工资标准等，你可以与公司进行沟通协商，要求恢复合理的薪酬水平。
收集证据并寻求法律帮助：
- 如果与公司沟通无果，你可以收集相关证据（如劳动合同、薪酬调整协议、加班记录等），向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 在这个过程中，如果你需要进一步的法律帮助或建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律意见。
总结来说，调整薪酬后加班费少两千是否合理，需要结合薪酬调整的合法性、薪酬结构的变化以及加班时间的变化等多个因素来综合判断。如果你对此存在疑问或担忧，建议及时审查相关合同和协议，并收集证据以备不时之需。同时，你也可以直接向我咨询更多关于劳动纠纷的法律问题。