针对员工请假未归的情况，处理时需要细致且遵循一定的流程，以确保既维护公司的规章制度，又保障员工的合法权益。以下是一些建议的处理步骤：

一、初步核实与沟通

1. 核实情况：首先，需要核实员工是否确实未按照请假流程进行申请或未按时返回工作岗位。这可以通过查看请假记录、与员工直接上级或同事沟通等方式进行。

2. 尝试联系：如果员工未归且未提前说明原因，应立即尝试通过电话、短信、邮件等多种方式联系员工，了解其未归的具体原因和预计返回时间。

二、根据情况分类处理

1. 程序性违规：

   • 如果员工只是违反了请假手续中的程序性规定（如延迟提交病假单、没有事先填写病假申请单等），但确实有合理的请假需求，公司不应剥夺其请假的实体权利。
   • 公司可以依据规章制度，对违反程序性规定的员工给予适当的处罚或警告，并要求其今后严格遵守请假流程。

2. 实体性违规：

   • 如果员工未履行请假手续中的实体规定（如不提交病假单），且这些规定是认定请假的依据，公司可以不认可其请假。
   • 在此情况下，公司应及时催告员工补办请假手续。如果员工无正当理由未予补办，公司可以按照旷工处理。

3. 旷工处理：

   • 旷工达到公司规章制度中规定的天数后，公司可以认定员工属于严重违规。
   • 根据《劳动合同法》第三十九条第二款，公司有权因员工严重违反规章制度而解除劳动关系。

4. 特殊情况处理：

   • 如果员工请假未归是因为弄虚作假、病假期间在外兼职或外出旅游等严重违反诚实信用的行为，公司不仅应按旷工处理，还可以在规章制度中明确此类行为属于严重违规，并据此解除劳动关系。

三、正式通知与证据留存

1. 发出书面通知：对于需要员工返回工作岗位或办理辞职手续的情况，公司应发出《限期到岗通知书》或相关书面通知，明确告知员工其权利和义务以及未按时返回的后果。

2. 证据留存：在处理过程中，公司应妥善留存所有与员工沟通、催告、通知等相关的证据，以备不时之需。

四、合法解除劳动关系

如果经过上述程序后，员工仍未按规定时间到岗履行劳动合同，公司应当及时按照公司规章制度做出相关处理决定，并合法解除与员工的劳动合同关系。在解除劳动关系时，公司应确保所有程序合法合规，避免引发劳动争议。

综上所述，处理员工请假未归的情况需要细致、谨慎且遵循一定的流程。公司应依据规章制度和法律法规进行操作，确保既维护公司的利益又保障员工的合法权益。