结论前置：扣实习生工资是否违法，需根据具体情况判断。一般情况下，未经法定程序或未征得实习生同意擅自扣除工资是违法的，但在特定情况下，如合同约定或经济损失赔偿等，扣除工资可能合法。
一、一般情况下的违法性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，虽然实习生与用人单位之间可能未签订正式的劳动合同，但实习生提供的劳动同样应获得相应的报酬。实习协议或双方口头约定的实习报酬及支付方式，在双方达成合意的情况下，具有法律效力。单位无故克扣工资，不仅违反了双方之间的约定，也可能违反民事法律的相关规定。
违法情形：
- 如果用人单位未经法定程序（如未与实习生协商、未告知扣除原因等）或未征得实习生同意，擅自扣除实习生工资，这通常被视为违法行为。实习生在提供正常劳务的情况下，单位随意克扣工资，侵害了实习生获取劳动报酬的权利。
二、合法扣除工资的情形
合同约定：
- 如果实习协议或双方之间的其他约定中明确规定了工资扣除的条件和标准（如实习生违反单位规定造成损失时的赔偿等），且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么在符合约定条件时，用人单位可以依法扣除部分工资。但需要注意的是，扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。
经济损失赔偿：
- 如果实习生因故意或重大过失给用人单位造成经济损失，单位有权依据相关规定和约定扣除部分工资作为赔偿。但扣除的金额需合理，一般不得超过实习生当月工资的20%（具体比例可能因地区而异，需参照当地相关规定），且扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。同时，单位需有充分证据证明损失的存在以及实习生的过错。
规章制度：
- 如果用人单位有明确、合理且已向实习生公示告知的规章制度，其中规定了可以扣除工资的情形（如迟到、早退等违反单位纪律的行为），且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位在符合规章制度要求的情况下可以扣除工资。
三、实习生的维权途径
协商与投诉：
- 实习生认为用人单位扣除工资的行为违法或不合理时，应先与用人单位进行协商沟通，要求其说明扣工资的原因并解决问题。如果协商不成，实习生可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
法律支持：
- 在维权过程中，实习生可以向我咨询以获取更具针对性的法律建议和帮助。我可以协助实习生分析案情、准备证据材料，并提供法律支持，确保实习生的权益得到充分保障。
举例说明：假设实习生小张与某公司签订了实习协议，约定每月工资为3000元。后因小张在工作中疏忽导致公司损失5000元，公司根据实习协议中的约定，决定从小张的工资中扣除1000元作为赔偿。在此情况下，如果扣除后的工资不低于当地最低工资标准，且公司能够证明损失的存在以及小张的过错，那么公司的扣除行为可能是合法的。但如果公司未经小张同意，擅自扣除其全部工资或扣除金额超过合理范围，则可能构成违法行为。
总结与建议：实习生在遇到工资被扣的情况时，应首先了解自己的权益和用人单位的扣除依据。如果认为扣除行为违法或不合理，应及时与用人单位沟通并寻求法律支持。同时，建议实习生在签订实习协议时，仔细阅读协议条款，特别是关于工资支付和扣除的部分，以确保自己的权益得到充分保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。