实习期扣除工资是否合法，需根据具体情况分析。以下是一些可能的情况及对应的法律解释：

1. 合法扣除的情况：

   • 因实习生本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照实习协议或劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。赔偿可以从实习生本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过实习生当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 如果实习生违反了公司的规章制度，例如旷工、迟到早退达到一定次数等，且公司事先有公示的相关规定，那么公司按照规定扣除相应工资也是合法的。

2. 不合法扣除的情况：

   • 如果没有任何正当理由，用人单位随意克扣实习生工资，则是不合法的。实习生在实习期间也享有获得劳动报酬的权利，其报酬的获取应依据实习协议或双方的约定等合法依据，用人单位不得无故侵害。

在遇到实习期工资被扣的情况时，实习生应首先尝试与用人单位沟通，了解其扣工资的具体理由和依据。如果认为用人单位的扣除行为不合法或不合理，实习生可以采取以下措施维护自己的权益：

• 与用人单位协商，要求其说明扣工资的理由并提供相关证据；
• 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，提交实习协议、工资条、考勤记录等证据，由劳动监察部门依法调查处理；
• 如果问题仍未解决，还可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，提交仲裁申请书及相关证据材料，通过法律途径维护自己的合法权益。

总之，实习期扣除工资是否合法需根据具体情况判断。实习生应了解自己的权益和维权途径，在遇到问题时及时采取措施保护自己的合法权益。