企业不能以不能胜任工作为直接理由开除员工，而是需要遵循一定的法定程序。若企业未按照法定程序处理，员工是有权要求赔偿的。以下是对这一问题的详细解答：

1. 企业不能直接以不能胜任为由开除员工：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条的规定，劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位仍不能胜任的，用人单位才可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。

2. 员工在不能胜任工作被辞退时的经济补偿：

   • 若企业已经履行了培训或调岗的义务，且员工仍然不能胜任工作，企业在提前通知或支付代通知金后解除劳动合同的，需要按照员工在本单位工作的年限支付经济补偿。具体为：每满一年支付一个月工资的标准向员工支付，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。
   • 若企业未履行培训或调岗的义务，或者未提前通知或支付代通知金就直接以不能胜任工作为由解除劳动合同的，这构成违法解除。此时，员工可以要求企业按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。

3. 特殊情况：

   • 如果员工存在严重违反规章制度、严重失职给用人单位造成重大损害、被依法追究刑事责任等过错情形，企业解除劳动合同无需支付经济补偿。
   • 如果员工处于医疗期、孕期、产期、哺乳期等特殊保护期间，且企业无以上过错为由辞退员工，若无法定事由，也属于违法辞退，员工可要求支付赔偿金。

综上所述，企业不能以不能胜任工作为直接理由开除员工，而是需要先证明员工不能胜任工作，然后经过培训或调岗，仍不能胜任的才可以解除劳动合同，并支付相应的经济补偿。如果企业未按照法定程序处理，员工有权要求赔偿。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。