结论：针对您描述的情况，拖欠的工资原则上应由合伙企业或仍在运营的老板承担支付责任，但具体责任承担方式需根据实际情况判断。以下从不同角度为您详细分析：
一、合伙企业债务承担原则
根据《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定，合伙企业对其债务，应先以其全部财产进行清偿。这意味着，如果两个老板合伙经营的企业拖欠了工资，那么该企业应首先以其资产来支付这些工资。若企业资产不足以清偿全部债务，包括工资在内的，合伙人（即两个老板）需承担无限连带责任。
具体分析：
- 无限连带责任：即每个合伙人都对企业的债务负有全部清偿的责任，债权人（如被拖欠工资的员工）有权要求任何一个合伙人清偿全部债务。因此，即使其中一个老板跑路，另一个仍在运营的老板仍有义务支付拖欠的工资。
- 追偿权：如果其中一个合伙人（如仍在运营的老板）支付了超出其应分担份额的债务，他有权向其他合伙人（如跑路的老板）追偿。但这属于合伙人之间的内部关系，不影响债权人向任何一个合伙人主张权利。
二、实际责任承担情况
若合伙企业仍在运营：
- 拖欠的工资应由合伙企业支付，但考虑到企业可能资金紧张，您可以直接向仍在运营的老板主张权利，要求其支付工资。
- 若老板拒绝支付，您可以向当地劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁，甚至提起诉讼来维护自己的合法权益。
若合伙企业已解散或无法继续运营：
- 您仍可以向仍在运营的老板主张权利，要求其承担无限连带责任，支付拖欠的工资。
- 若该老板也无力支付，您可以尝试查找跑路老板的财产线索，向法院申请强制执行其财产来清偿债务。但这一过程可能较为复杂且耗时较长。
三、建议与措施
收集证据：
- 保留好与工资相关的证据，如工资条、劳动合同、工作证等，以便在主张权利时提供证明。
协商与投诉：
- 首先尝试与仍在运营的老板进行协商，要求其支付拖欠的工资。
- 若协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉，或向劳动仲裁机构申请仲裁。
法律途径：
- 若上述途径均无法解决问题，您可以考虑向法院提起诉讼，要求合伙企业或仍在运营的老板支付拖欠的工资。
- 在诉讼过程中，您可以申请财产保全措施，以确保判决后能够顺利执行。
最后，面对此类情况，您应保持冷静并积极采取措施来维护自己的合法权益。如果您在处理过程中遇到任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。