下班途中发生车祸且自己负主要责任的情况下，公司是否应扣工资，需分情况讨论：

1. 若车祸导致受伤被认定为工伤：

   • 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。但在此案例中，由于您自己负主要责任，通常情况下，这种情况不会被认定为工伤。不过，若存在特殊情形（如对方车辆存在严重过错，而您仅因轻微违规承担主要责任），且经劳动行政部门认定为工伤，那么您在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这意味着，如果被认定为工伤，公司不应扣工资。

2. 若车祸未被认定为工伤：

   • 在此情况下，由于车祸并非因工作原因导致，且您自己负主要责任，公司可能会根据内部规章制度或劳动合同中的相关条款，对您的工资进行相应调整。但公司扣工资的行为必须合法合规，不能违反《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定。
   • 根据《劳动法》和《劳动合同法》，用人单位不得无故克扣劳动者工资。如果公司因您未提供正常劳动而扣工资，需确保扣减的工资数额合理，且符合劳动合同或公司规章制度的规定。若公司扣工资的行为缺乏合法依据，您有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

建议与注意事项：

• 及时与公司沟通：在发生车祸后，及时与公司沟通，说明情况，并了解公司对于此类事件的内部规定和处理方式。
• 保留相关证据：如医疗证明、交通事故责任认定书等，以备不时之需。
• 寻求法律帮助：如果您对公司的处理方式有异议，或者认为公司扣工资的行为违法，可以寻求法律帮助，维护自己的合法权益。

总结：下班途中发生车祸且自己负主要责任时，公司是否扣工资取决于车祸是否被认定为工伤以及公司内部规章制度的规定。如果被认定为工伤，公司不应扣工资；如果未被认定为工伤，公司扣工资的行为必须合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。