您好，关于个体工商户已经注销后员工是否能起诉补交社保的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，社会保险费补缴应当由欠费单位向社会保险经办机构提出书面申请，这是正常的补缴流程。然而，如果欠费单位在市场监管信息中已经注销或吊销，那么原则上社会保险经办机构将不再受理补缴申请。这是因为单位注销后，其社保账号也随之不存在，劳动者无法再要求以该账号为其补缴社保。

但是，也存在一些特殊情况。比如，如果员工是国家正式职工身份，如80、90年代的原固定工、合同制职工，且其符合计算连续工龄欠费时间段在本人档案中有明确记载，那么员工可以写委托书，委托现参保单位办理补缴手续。

另外，如果个体工商户在注销前未依法支付员工的工资、社会保险费用和法定补偿金，就恶意注销，那么清算组成员或相关责任人应承担相应的责任，公司所欠缴的社会保险等费用应由他们继续承担缴纳义务。在这种情况下，员工可以通过法律途径来维护自己的合法权益，要求相关责任人补缴社保。

综上所述，个体工商户注销后，员工是否能起诉补交社保取决于具体情况。如果欠费单位已经注销且不存在上述特殊情况或恶意注销的情况，那么员工可能无法直接通过社会保险经办机构来补缴社保。但是，如果员工认为自己的权益受到了侵害，可以咨询专业律师或相关机构，寻求法律帮助来维护自己的合法权益。

最后，我建议您在劳动合同履行过程中，用人单位应依法及时申报和缴纳职工社保，以避免类似问题的发生。同时，员工也应积极、及时向用人单位主张自己的权益，确保自己的社保得到及时缴纳。