结论前置：在父母仍然健在的情况下，他们有权卖掉自己的房产，即使他们已与村委会签订协议，表示百年之后将房产留给儿子。

详细分析：

1. 产权归属：

   • 根据我国《民法典》的相关规定，不动产（如房产）的产权以登记为准。既然房产证上写的是父母的名字，那么在没有其他相反证据的情况下，该房产的产权就归属于父母。
   • 父母作为产权人，有权对自己的房产进行处分，包括出售、赠与、抵押等。

2. 协议性质与效力：

   • 父母与村委会签订的协议，从性质上看，更像是一种遗赠扶养协议或者是一种附条件的赠与协议。这种协议在父母健在时并不产生产权转移的效果。
   • 即使协议中明确表示“百年之后留给儿子”，这也只是表示在父母去世后，儿子有权按照协议获得房产。在父母健在时，这个协议并不剥夺父母对房产的处分权。

3. 出售房产的合法性：

   • 既然父母是房产的合法产权人，他们就有权出售该房产。出售时，需要遵循相关的法律法规，如办理产权过户手续、缴纳相关税费等。
   • 出售房产并不违反父母与村委会签订的协议，因为协议并未限制父母在健在时处分自己的房产。

综上所述，父母在健在时有权卖掉自己的房产，即使他们已与村委会签订协议表示百年之后将房产留给儿子。这是因为产权归属于父母，他们作为产权人有权对自己的房产进行处分。如果出售房产后，父母与儿子之间或者与村委会之间因此产生纠纷，可以依据相关法律法规和协议内容来解决。