结论：小儿子是否有份，主要取决于20年前的协议是否有效且明确排除了小儿子的权益，同时需考虑母亲去世后的继承问题。以下从多个角度进行分析：

一、协议的有效性及内容

1. 协议的有效性：

   • 如果20年前的协议是父亲、母亲以及大儿子、小儿子共同签订，且各方均具备完全民事行为能力，协议内容合法，那么该协议是有效的。
   • 如果协议并非各方共同签订，或者存在欺诈、胁迫等情形，那么协议可能无效或可撤销。

2. 协议的内容：

   • 如果协议明确约定房产归大儿子所有，且排除了小儿子的权益，那么在没有其他法定情形（如协议被撤销、变更等）下，小儿子通常无权主张房产份额。
   • 如果协议内容模糊，或者未明确排除小儿子的权益，那么可能需要进一步分析协议的具体条款和各方当事人的真实意思表示。

二、母亲去世后的继承问题

1. 继承的开始：

   • 母亲去世后，其遗产（包括在房产中的份额，如果母亲在房产中有份额的话）开始继承。

2. 继承人的确定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，第一顺序继承人包括配偶、子女、父母。因此，在母亲去世后，父亲、大儿子、小儿子（以及其他可能的继承人，如母亲的父母）均有可能成为继承人。

3. 继承份额的分配：

   • 如果母亲在房产中有份额，且没有留下遗嘱指定继承人，那么其份额将按照法定继承进行分配。通常情况下，各继承人将平均分配母亲的遗产份额。
   • 如果母亲留下了遗嘱，且遗嘱内容合法有效，那么其遗产将按照遗嘱进行分配。

三、综合分析

1. 如果协议有效且明确排除小儿子的权益：

   • 在这种情况下，小儿子通常无权主张房产份额。但是，如果母亲在房产中有份额，且这部分份额未被协议涵盖或母亲去世后这部分份额成为遗产，那么小儿子作为继承人之一，有权继承这部分份额。

2. 如果协议无效或内容模糊：

   • 在这种情况下，可能需要通过法律途径来确定房产的归属和各方的权益。法院将根据协议的具体条款、各方当事人的真实意思表示以及相关法律法规进行裁决。

3. 特殊情况：

   • 如果存在其他特殊情况（如父亲在母亲去世后将房产全部赠与大儿子、小儿子对母亲尽了主要赡养义务等），也可能影响房产的分配和小儿子的权益。

四、建议

1. 审查协议：

   • 首先审查20年前的协议，确定其有效性和具体内容。如果协议存在疑问或争议，建议咨询专业律师进行解读和评估。

2. 了解继承情况：

   • 了解母亲去世后的继承情况，包括是否有遗嘱、继承人有哪些、继承份额如何分配等。这有助于确定小儿子在房产中的潜在权益。

3. 协商或诉讼：

   • 如果各方对房产的归属和权益存在争议，建议首先尝试通过协商解决。如果协商无果，可以考虑通过法律途径（如诉讼）来解决争议。

在处理此类问题时，请务必保持冷静和理性，通过合法途径来维护自己的权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。