结论：单位加班费原本是17块钱，部门私自调整为5块5，这一行为是否违法，需结合具体情况来判断，但在大多数情况下，这种私自调整加班费的行为是违法的。
分析说明：
加班费的法律规定：
- 根据《劳动法》及相关规定，劳动者在加班时，用人单位应当按照法律规定支付加班费。加班费的标准通常是根据劳动者的基本工资和加班时间来计算的，且不得低于法定标准。
部门私自调整加班费的违法性：
- 部门作为用人单位的一个内部机构，无权私自调整加班费的标准。加班费的支付标准是由用人单位整体决定的，并需符合法律法规的规定。部门私自调整加班费，实际上是对劳动者劳动报酬的非法剥夺，违反了《劳动法》中关于劳动报酬支付的规定。
可能的例外情况：
- 虽然部门私自调整加班费在大多数情况下是违法的，但也存在一些例外情况。例如，如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定了加班费的调整机制，且该机制不违反法律法规的强制性规定，那么部门按照合同约定调整加班费可能是合法的。但这种情况较为少见，且需要严格的合同条款支持。
劳动者的维权途径：
- 如果劳动者发现部门私自调整了加班费，且认为这一行为侵犯了自己的合法权益，可以通过以下途径维权：首先，与用人单位协商解决；其次，向当地劳动监察部门投诉；最后，如果协商和投诉均无果，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者向人民法院提起诉讼。
建议与行动：
- 核实情况：劳动者应首先核实自己的加班费是否被部门私自调整，并了解调整的具体原因和依据。
- 收集证据：如果确认加班费被非法调整，劳动者应收集相关证据，如工资条、加班记录、劳动合同等，以备维权之需。
- 及时维权：劳动者应在发现加班费被非法调整后及时维权，避免超过法定时效期间而丧失维权机会。
后续思考依据：
- 劳动者在维权过程中，应关注用人单位是否违反了《劳动法》中关于劳动报酬支付的规定，以及是否侵犯了自己的合法权益。
- 劳动者在维权时，也可以参考类似案例的判决结果，以了解法院对于此类纠纷的裁判态度和标准。
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