合同上写着加班费5元一小时，这一条款是否违法，需结合具体情况来判断。以下是从不同角度的详细分析：
与法定加班费标准的对比：
- 根据《劳动法》及相关规定，加班费的标准通常与劳动者的正常工资水平、加班时间等因素有关。一般来说，工作日加班的工资应不低于正常工资的150%，休息日加班且未安排补休的，工资应不低于正常工资的200%，法定节假日加班的，工资应不低于正常工资的300%。
- 如果合同中约定的加班费5元一小时，明显低于上述法定标准，且劳动者的正常工资水平较高，那么这一条款很可能被视为违法，因为它侵犯了劳动者获得合理加班费的权利。
合同条款的效力：
- 合同是双方自愿达成的协议，但合同内容不得违反法律、行政法规的强制性规定。如果合同中的加班费条款违反了法定加班费标准，那么该条款可能被视为无效或可撤销。
- 劳动者有权要求用人单位按照法定标准支付加班费，如果用人单位拒绝，劳动者可以通过劳动争议调解、仲裁或诉讼等途径维护自己的合法权益。
实际操作的考量：
- 在实际操作中，除了考虑法定加班费标准外，还需要考虑劳动者的实际工资水平、加班时间、用人单位的经营状况等因素。如果劳动者的正常工资水平较低，且加班时间不长，那么5元一小时的加班费可能在一定程度上被接受。
- 但无论如何，用人单位都不能以低于法定标准的方式支付加班费，否则将面临法律责任。
建议：
- 对于劳动者而言，如果发现合同中的加班费条款违法或不合理，应及时与用人单位沟通协商，要求修改合同条款或按照法定标准支付加班费。
- 如果协商无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动争议仲裁，以维护自己的合法权益。
- 对于用人单位而言，应严格遵守劳动法律法规，合理制定加班费标准，避免因此引发劳动争议和法律风险。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。