结论：当合同中约定了仲裁而当事人却在法院起诉时，被上诉人（即被告）可以在法院首次开庭前，以存在有效的书面仲裁协议为由向法院提出异议，请求法院驳回原告的起诉。
法律背景与解释：
仲裁协议的效力：
- 根据《中华人民共和国仲裁法》第十六条，仲裁协议是合同中订立的仲裁条款或以其他书面方式在纠纷发生前或后达成的请求仲裁的协议。它必须包含请求仲裁的意思表示、仲裁事项以及选定的仲裁委员会。
- 若合同中明确约定了仲裁作为争议解决方式，并且该仲裁协议符合上述法律规定，则该仲裁协议具有法律效力，对双方当事人具有约束力。
法院对仲裁协议的审查：
- 根据《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二百一十六条，在法院首次开庭前，被告可以以存在书面仲裁协议为由对受理的民事案件提出异议。
- 法院在审查时，会确认仲裁协议是否有效，包括是否符合仲裁法第十六条的规定，以及是否存在仲裁法第十七条规定的无效情形。
提出异议的时机与后果：
- 被告必须在法院首次开庭前提出异议，否则可能被视为放弃仲裁协议的权利，法院将继续审理案件。
- 如果法院经审查认为仲裁协议有效，且不存在其他不应受理的情形，法院将裁定驳回原告的起诉，案件将转入仲裁程序。
法律建议：
准备异议材料：
- 被告应准备充分的异议材料，包括合同中的仲裁条款、仲裁协议（如有）、以及可能支持仲裁协议有效性的其他证据。
及时提出异议：
- 被告应在收到法院起诉状副本后，尽快准备并提交异议申请，确保在法院首次开庭前提出。
关注法院审查结果：
- 被告应密切关注法院对异议的审查结果，如果法院裁定驳回起诉，被告应准备参与仲裁程序；如果法院未驳回起诉，被告则需准备应对法院的诉讼程序。
可能的情况与应对：
如果仲裁协议被认定有效：
- 法院将裁定驳回原告的起诉，案件将转入仲裁程序。被告应积极参与仲裁，准备仲裁所需的证据和材料。
如果仲裁协议被认定无效或存在争议：
- 法院可能继续审理案件。被告应准备应对诉讼，包括提交答辩状、参加庭审等。同时，被告也可以考虑与原告协商重新达成仲裁协议或选择其他争议解决方式。
后续行动建议：
- 在整个过程中，被告应保持与原告的沟通，尝试通过协商解决争议，以减少诉讼或仲裁的成本和时间。
- 如果被告对法院的裁定或仲裁结果不服，可以根据相关法律规定提起上诉或申请撤销仲裁裁决。
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