结论前置：自离后劳动合同未解除，无论是公司还是员工，都应遵循法定程序处理劳动合同的解除问题。员工应主动与公司沟通协商，必要时可通过法律途径维护自身权益；公司则应及时与员工联系，依法处理劳动关系，避免法律风险。
一、员工应采取的措施
了解法律后果：
- 自离并不代表劳动合同自动解除。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，任何一方要解除劳动合同，都必须遵循法定程序和条件。
- 若未依法解除劳动合同，员工可能面临被追究违约责任、赔偿损失等法律后果。
主动与公司沟通：
- 说明原因：员工应主动与公司联系，诚恳说明离职原因和意愿，表达希望和平解除劳动合同的愿望。
- 协商解除：与公司协商解除劳动合同的具体事宜，如离职时间、经济补偿等，争取达成一致意见。
保留证据：
- 在离职过程中，员工应保留好与公司沟通的记录、离职申请、工作交接清单等相关证据，以备将来可能出现的争议。
依法维权：
- 若公司拒绝配合办理解除劳动合同手续，员工可向当地劳动监察部门投诉，提交相关证据，要求劳动监察部门介入调查并处理。
- 若对劳动监察部门的处理结果不满意，或公司仍拒绝解除合同，员工可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求解除合同并赔偿损失。
二、公司应采取的措施
联系员工：
- 公司应通过电话、邮件等多种方式尝试联系员工，了解其离职原因和意图，鼓励其回来办理离职手续。
- 明确告知员工未解除劳动合同可能带来的法律后果，如被追究违约责任、赔偿损失等。
发送书面通知：
- 若员工未按公司要求回来办理离职手续，公司可向员工发送书面通知，要求其在规定时间内回来办理离职手续并解除劳动合同。
- 通知中应明确告知不按时回来的可能后果，如按旷工处理、依法解除劳动合同等，并保留好通知的送达凭证。
依法处理劳动关系：
- 若员工未按通知要求回来，公司可依据规章制度按旷工处理，直至依法解除劳动合同。
- 在解除劳动合同的过程中，公司应确保操作的合法性和有效性，如出具《解除劳动合同通知书》等。
完善管理：
- 公司应规范离职流程，及时更新员工档案，避免类似情况再次发生。
- 加强员工法律意识培训，提高员工对劳动合同解除程序的认识和遵守意识。
三、特殊情况下的处理建议
协商一致解除：
- 双方可通过签订协议明确解除时间、经济补偿等内容，确保解除过程的和平与顺利。
工会介入调解：
- 若涉及争议，双方可请求工会协助协商解决，以维护各自的合法权益。
第三方见证备案：
- 在重要文件签署时，可邀请公证处或律师见证，增强法律效力和证据力。
四、注意事项
- 时效性：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，无论是公司还是员工，都应及时采取行动，避免超过时效期间。
- 程序合法性：在解除劳动合同的过程中，双方都应遵循法定程序，确保操作的合法性和有效性。任何一方违反法定程序解除劳动合同，都可能面临法律责任和纠纷。
总之，自离后劳动合同未解除是一个涉及多方权益的复杂问题。无论是公司还是员工，都应保持冷静和理性，遵循法律法规和劳动合同的约定，通过和平、协商的方式解决纠纷。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。