结论：领导同意且工队内部全员同意，但没经过车间职代会，这一做法是否合法，需结合具体情况判断，若相关决策事项依法应经职代会审议通过，则未经职代会同意不合法；若相关决策事项无需职代会审议，则不影响其合法性。以下从不同角度详细分析：
一、职代会的法律地位与职权
根据《企业民主管理规定》等相关法律法规，职工代表大会（职代会）是企业实行民主管理的基本形式，是职工行使民主管理权力的机构。职代会依法行使审议建议、审议通过、评议监督等职权，其中涉及职工切身利益的重大事项，如劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利等，应当依法经职代会审议通过。
二、决策事项是否需职代会审议
若决策事项属于职代会审议范围：
- 根据法律规定，若相关决策事项（如调整工作时间、改变劳动条件、制定或修改规章制度等）依法应经职代会审议通过，则未经职代会同意，即使领导和工队内部全员同意，该决策也可能因违反法定程序而不合法。
- 法律依据：《企业民主管理规定》第十三条：“职工代表大会行使下列职权：……（四）审议通过集体合同草案，按照国家有关规定提取的职工福利基金使用方案、住房公积金和社会保险费缴纳比例和时间的调整方案，劳动模范的推荐人选等重大事项；……”。若决策事项属于此类“重大事项”，则未经职代会审议通过不合法。
若决策事项不属于职代会审议范围：
- 若相关决策事项（如日常生产安排、技术改进等）不属于职代会审议范围，则未经职代会同意不影响其合法性。此时，领导和工队内部全员的同意即构成有效决策。
三、合法性判断的其他因素
公司章程或内部规章制度：
- 除法律法规外，公司章程或内部规章制度也可能对职代会的职权和决策程序作出规定。若相关决策事项虽非法律法规明确要求职代会审议，但公司章程或规章制度规定需经职代会同意，则未经职代会同意同样不合法。
决策程序的瑕疵是否影响实体权利：
- 即使决策程序存在瑕疵（如未经职代会审议），若该瑕疵未对职工的实体权利造成实质性损害，且职工未提出异议，则该决策可能仍被视为有效。但这种情况较为特殊，需结合具体案情判断。
四、建议与风险提示
建议：
- 在作出涉及职工切身利益的决策前，企业应仔细审查相关法律法规和公司章程、内部规章制度，明确职代会的职权和决策程序。
- 若决策事项依法或依规应经职代会审议通过，则务必履行相关程序，确保决策的合法性。
风险提示：
- 若企业未经职代会同意作出涉及职工切身利益的决策，可能面临职工投诉、劳动争议仲裁或诉讼等风险。
- 一旦决策被认定为不合法，企业可能需要承担撤销决策、赔偿损失等法律责任。
总结：领导同意且工队内部全员同意，但没经过车间职代会，这一做法是否合法需结合决策事项是否属于职代会审议范围、公司章程或内部规章制度的规定以及决策程序是否对职工实体权利造成实质性损害等因素综合判断。如有具体法律问题，可直接向我咨询。