公司职工代表大会做出的决定是否合法，需视具体情况而定，不能一概而论。以下从不同角度为您详细分析：
一、决定内容合法性
内容不违反法律法规：
- 职工代表大会做出的决定，其内容必须符合国家法律法规的规定，不得与法律相抵触。例如，决定不能违反劳动法、公司法等相关法律法规中关于职工权益、公司治理等方面的规定。
- 若决定内容违法，则该决定无效。例如，决定降低职工法定工资标准、剥夺职工法定休假权利等，均属于违法行为，决定无效。
内容符合公司章程和内部规定：
- 除了符合国家法律法规外，职工代表大会的决定还应符合公司章程和内部规定。公司章程是公司的“宪法”，规定了公司的组织架构、运营方式等基本事项。
- 若决定内容违反公司章程或内部规定，可能面临被撤销或无效的风险。例如，公司章程规定职工代表大会无权决定某类事项，但职工代表大会却做出了相关决定，则该决定可能因违反公司章程而无效。
二、决定程序合法性
召开程序合法：
- 职工代表大会的召开应遵循一定的程序，包括会议通知、议程安排、代表选举等。这些程序应确保所有职工代表能够充分参与会议，表达意见。
- 若召开程序存在瑕疵，如未提前通知、代表选举不合法等，可能影响决定的合法性。例如，未提前通知职工代表参加会议，导致部分代表无法出席，则会议做出的决定可能因程序不合法而受到质疑。
表决程序合法：
- 职工代表大会做出的决定应通过合法的表决程序产生。表决程序应确保所有出席会议的代表能够充分表达意见，并按照规定的表决方式进行投票。
- 若表决程序存在瑕疵，如未按照规定的表决方式进行、表决结果未达到法定要求等，可能影响决定的合法性。例如，规定需三分之二以上代表同意才能通过的决定，但实际表决时未达到该比例，则决定可能因表决程序不合法而无效。
三、决定执行与监督
决定执行：
- 职工代表大会做出的决定应得到公司的有效执行。公司应制定相应的执行计划和措施，确保决定能够得到落实。
- 若公司未执行或未完全执行决定，可能面临法律责任。例如，决定提高职工福利待遇，但公司未执行，则职工有权要求公司履行决定，并可能通过法律途径维护自身权益。
监督机制：
- 公司应建立对职工代表大会决定的监督机制，确保决定的合法性和合理性。监督机制可以包括内部监督、外部监督等多种形式。
- 若监督机制缺失或失效，可能导致决定违法或不合理。例如，缺乏内部监督机制，导致职工代表大会做出的决定存在违法或不合理内容，且未得到及时纠正。
法律建议
- 对于公司而言：应确保职工代表大会的召开和表决程序合法合规，决定内容符合国家法律法规和公司章程的规定。同时，应建立有效的执行和监督机制，确保决定能够得到落实并受到监督。
- 对于职工而言：若认为职工代表大会做出的决定违法或不合理，可以通过内部申诉、法律途径等方式维护自身权益。在维护权益时，应提供充分的证据证明决定的违法性或不合理性。
若您对公司职工代表大会决定的合法性有具体疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供详细的法律分析和建议。