在您描述的情况下，即工作单位和发工资单位不是一个公司时，工伤认定一般是以实际工作单位为准，但具体还需结合实际情况和相关证据来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 工伤认定的基本原则：

   • 根据《工伤保险条例》及相关规定，工伤认定主要关注的是职工与用人单位之间是否存在劳动关系，以及职工是否在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害。
   • 在此情况下，虽然发工资的单位与实际工作单位不一致，但工伤认定的核心在于确定职工的实际工作单位和劳动关系。

2. 实际工作单位的认定：

   • 实际工作单位是指职工实际提供劳动、接受管理的单位。这通常通过劳动合同、工作证、考勤记录、工资支付记录等证据来证明。
   • 如果职工与实际工作单位签订了劳动合同，或者有充分证据证明职工在该单位工作并接受其管理，那么该单位通常被认定为工伤认定的责任主体。

3. 发工资单位的作用：

   • 发工资单位虽然与职工有经济往来，但并不一定构成劳动关系。如果发工资单位只是代发工资，而职工并不在该单位工作或接受其管理，那么该单位通常不被视为工伤认定的责任主体。
   • 然而，如果发工资单位与实际工作单位之间存在关联关系（如母子公司、总分机构等），或者发工资单位在工伤事故中存在过错（如未按时足额支付工资导致职工经济困难而影响工作安全等），那么发工资单位也可能在某种程度上承担责任。但这种情况较为复杂，需要具体分析。

4. 实际操作建议：

   • 如果您遇到此类情况，首先应收集与实际工作单位相关的证据，如劳动合同、工作证、考勤记录等，以证明您与该单位存在劳动关系。
   • 同时，您也可以咨询当地劳动保障部门或社保机构，了解具体的工伤认定流程和所需材料。
   • 在申请工伤认定时，应如实填写相关信息，并提供充分的证据来支持您的申请。如果发工资单位与实际工作单位不一致，您应在申请中说明情况，并提供相关证据来证明实际工作单位。

5. 可能的法律后果：

   • 如果工伤认定成功，您将有权享受工伤保险待遇，包括医疗费用、伤残津贴、一次性工伤医疗补助金等。
   • 如果实际工作单位拒绝承担责任或无法联系到该单位，您可能需要通过法律途径来维护自己的权益。在这种情况下，发工资单位如果与实际工作单位存在关联关系或过错，也可能被卷入法律纠纷中。

总结来说，在您描述的情况下，工伤认定一般是以实际工作单位为准。但具体还需结合实际情况和相关证据来判断。如果您遇到此类问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和指导。