针对劳动合同中存在矛盾之处，特别是关于工时制和工资包含加班工资的表述不一致的情况，你可以按照以下步骤处理：

1. 明确合同条款的优先级与解释原则：

   • 在劳动合同中，如果存在多处相互矛盾或模糊不清的条款，首先应当尝试通过协商，与用人单位明确各条款的具体含义和适用条件。
   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同应当明确约定工作内容、工作地点、工作时间和休息休假、劳动报酬等关键条款。若条款存在歧义，应倾向于保护劳动者的合法权益进行解释。

2. 分析工时制与工资构成的矛盾：

   • 标准工时制：通常指的是每日工作不超过8小时，每周工作不超过40小时，且每周至少休息1日的工时制度。在标准工时制下，加班工资是额外支付的，不包含在正常工资内。
   • 工资包含加班工资：若合同中明确表述工资已包含加班工资，这可能与标准工时制的常规理解相悖。这种情况下，需要明确加班工资的计算基数、计算方式以及加班时间的认定标准。

3. 具体处理建议：

   • 与用人单位协商：首先，建议与用人单位进行沟通，明确双方对工时制和工资构成的理解，尝试达成一致意见。可以要求用人单位提供详细的工资构成说明，包括基本工资、加班工资、奖金等各部分的金额和计算方式。
   • 收集证据：如果协商无果，建议收集相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明自己的工作时间和加班情况。这些证据将有助于在后续的争议解决中维护自己的权益。
   • 申请劳动仲裁或提起诉讼：若用人单位拒绝调整合同条款或拒绝支付应得的加班工资，可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，或者依法向人民法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，需要提供充分的证据来支持自己的主张。

4. 法律后果与风险提示：

   • 如果劳动合同中的矛盾条款导致劳动者的权益受到侵害，如未支付加班工资等，用人单位可能面临支付加班工资、经济补偿金等法律责任。
   • 同时，劳动者也需要注意，如果故意隐瞒或提供虚假信息以获取不当利益，也可能承担相应的法律责任。

举例说明： 假设你的劳动合同中既约定了标准工时制，又表述工资已包含加班工资。在实际工作中，你经常加班但未获得额外的加班工资。这种情况下，你可以先与用人单位协商，要求明确工资构成和加班工资的计算方式。如果协商无果，你可以收集考勤记录、工资条等证据，向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求用人单位支付应得的加班工资。

总结与建议： 劳动合同中的矛盾条款可能给双方带来不必要的争议和风险。因此，在签订劳动合同时，建议双方仔细阅读合同条款，确保各条款之间的一致性和明确性。如果遇到矛盾条款或模糊不清的情况，应及时与用人单位沟通并寻求解决方案。如有需要，可以直接向我咨询相关法律问题，我会为你提供专业的法律建议。