公司这种做法是违法的。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从罚款的合法性角度

   • 根据我国相关法律规定，用人单位并不具有对员工进行罚款的行政处罚权。行政处罚权只能由法律、法规规定的行政机关或者法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织在法定职权范围内实施。公司作为用人单位，并非行政机关，也不属于法律、法规授权的具有管理公共事务职能的组织，所以其无权对员工进行罚款。因此，公司以不按时上交现金为由对员工进行罚款，这种行为缺乏法律依据，是违法的。

2. 从工资支付和扣除角度

   • 即使员工存在某些违反公司规定的行为，公司在处理员工工资时也受到严格限制。根据《工资支付暂行规定》第十六条规定，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 而公司要求月底现金清零且三天上交，不上交就罚款，这并不属于上述法律规定的因劳动者原因给用人单位造成经济损失而进行赔偿扣除工资的情形。公司这种随意罚款的行为，侵犯了员工获得劳动报酬的权利，是违法的。

3. 从公司规章制度角度

   • 公司的规章制度要合法有效，必须满足内容合法、程序合法等条件。内容合法要求规章制度不得违反国家法律、行政法规及政策规定；程序合法一般要求规章制度需经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，并且要进行公示或者告知劳动者。
   • 如果公司以这种违法的罚款规定作为规章制度的一部分，由于其内容本身违反了法律的强制性规定，即使经过了合法的程序制定和公示，该规章制度中关于罚款的部分也是无效的，不能作为处罚员工的依据。

如果公司存在这种违法行为，你可以先与公司协商解决，要求公司停止这种违法行为并返还已扣除的罚款；如果协商不成，你可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司改正；你也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。如果你还有其他疑问，欢迎继续向我咨询。